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Enregistrement W4399090665 · doi:10.1111/gcb.17295

Unearthing the soil‐borne microbiome of land plants

2024· article· en· W4399090665 sur OpenAlexaff
Raúl Ochoa‐Hueso, David J. Eldridge, Miguel Berdugo, Pankaj Trivedi, Blessing Sokoya, Concha Cano‐Díaz, Sebastián Abades, Fernando D. Alfaro, Adebola R. Bamigboye, Felipe Bastida, José Luis Blanco‐Pastor, Asunción de los Rı́os, Jorge Durán, Stefan Geisen, Tine Grebenc, Javier Gutiérrez Illán, Yu‐Rong Liu, Thulani P. Makhalanyane, Steven D. Mamet, Marco A. Molina‐Montenegro, José L. Moreno, Tina Unuk Nahberger, Gabriel F. Peñaloza‐Bojacá, César Plaza, Ana Rey, Alexandra Rodríguez, Christina Siebe, Brajesh K. Singh, Alberto L. Teixido, Cristian Torres‐Díaz, Ling Wang, Jianyong Wang, Juntao Wang, Eli Zaady, Xiaobing Zhou, Xinquan Zhou, Leho Tedersoo, Manuel Delgado‐Baquerizo

Notice bibliographique

RevueGlobal Change Biology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesAgencia Estatal de InvestigaciónEuropean Regional Development FundEuropean Agricultural Fund for Rural DevelopmentGlobal Obesity Prevention Center, Johns Hopkins UniversityJunta de AndalucíaMinisterio de Ciencia e InnovaciónBritish Ecological SocietyEuropean CommissionConsejería de Transformación Económica, Industria, Conocimiento y UniversidadesJavna Agencija za Raziskovalno Dejavnost RSEcological Society of America
Mots-clésMicrobiomeEnvironmental scienceGeographyEcologyEarth scienceGeologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Plant–soil biodiversity interactions are fundamental for the functioning of terrestrial ecosystems. Yet, the existence of a set of globally distributed topsoil microbial and small invertebrate organisms consistently associated with land plants (i.e., their consistent soil‐borne microbiome), together with the environmental preferences and functional capabilities of these organisms, remains unknown. We conducted a standardized field survey under 150 species of land plants, including 58 species of bryophytes and 92 of vascular plants, across 124 locations from all continents. We found that, despite the immense biodiversity of soil organisms, the land plants evaluated only shared a small fraction (less than 1%) of all microbial and invertebrate taxa that were present across contrasting climatic and soil conditions and vegetation types. These consistent taxa were dominated by generalist decomposers and phagotrophs and their presence was positively correlated with the abundance of functional genes linked to mineralization. Finally, we showed that crossing environmental thresholds in aridity (aridity index of 0.65, i.e., the transition from mesic to dry ecosystems), soil pH (5.5; i.e., the transition from acidic to strongly acidic soils), and carbon (less than 2%, the lower limit of fertile soils) can result in drastic disruptions in the associations between land plants and soil organisms, with potential implications for the delivery of soil ecosystem processes under ongoing global environmental change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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