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Enregistrement W4399128749 · doi:10.1038/s41592-024-02285-8

A bistable inhibitory optoGPCR for multiplexed optogenetic control of neural circuits

2024· article· en· W4399128749 sur OpenAlexfundno aff
Jonas Wietek, Adrianna Nozownik, Mauro Pulin, Inbar Saraf‐Sinik, Noa Matosevich, Raajaram Gowrishankar, Asaf Gat, Daniela Malan, Bobbie J. Brown, Julien Dine, Bibi Nusreen Imambocus, Rivka Levy, Kathrin Sauter, Anna Litvin, Noa Regev, Suraj Subramaniam, Khalid Abrera, Dustin Summarli, Eva Madeline Goren, Gili Mizrachi, Eyal Bitton, Asaf Benjamin, Bryan A. Copits, Philipp Sasse, Benjamin R. Rost, Dietmar Schmitz, Michael R. Bruchas, Peter Soba, Meital Oren‐Suissa, Yuval Nir, J. Simon Wiegert, Ofer Yizhar

Notice bibliographique

RevueNature Methods · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiquePhotoreceptor and optogenetics research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeRuhr-Universität BochumUniversity of North Carolina at Chapel HillEuropean CommissionTel Aviv UniversityHorizon 2020 Framework ProgrammeIsrael Science FoundationOffice of Extramural Research, National Institutes of HealthCharité – Universitätsmedizin BerlinWeizmann Institute of ScienceHumboldt-Universität zu BerlinMinerva FoundationDeutsche ForschungsgemeinschaftAzrieli FoundationUniversity of WashingtonQueen Mary University of LondonEuropean Molecular Biology OrganizationNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésOptogeneticsBistabilityNeuroscienceOpsinBiological neural networkChannelrhodopsinInhibitory postsynaptic potentialMultiplexingNeurotransmissionSynapseBiologyComputer scienceReceptorPhysicsRhodopsin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Information is transmitted between brain regions through the release of neurotransmitters from long-range projecting axons. Understanding how the activity of such long-range connections contributes to behavior requires efficient methods for reversibly manipulating their function. Chemogenetic and optogenetic tools, acting through endogenous G-protein-coupled receptor pathways, can be used to modulate synaptic transmission, but existing tools are limited in sensitivity, spatiotemporal precision or spectral multiplexing capabilities. Here we systematically evaluated multiple bistable opsins for optogenetic applications and found that the Platynereis dumerilii ciliary opsin (PdCO) is an efficient, versatile, light-activated bistable G-protein-coupled receptor that can suppress synaptic transmission in mammalian neurons with high temporal precision in vivo. PdCO has useful biophysical properties that enable spectral multiplexing with other optogenetic actuators and reporters. We demonstrate that PdCO can be used to conduct reversible loss-of-function experiments in long-range projections of behaving animals, thereby enabling detailed synapse-specific functional circuit mapping.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,483
Score d'incertitude au seuil0,808

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,448
Écart entre enseignants0,387 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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