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Enregistrement W4399138216 · doi:10.1101/2024.05.28.24308052

Longitudinal Influenza A Virus Screening of Retail Milk from Canadian Provinces (Rolling Updates)

2024· preprint· en· W4399138216 sur OpenAlexafffundabout
Hannah L. Wallace, Jordan Wight, Mariana Baz, Barbara Dowding, Louis Flamand, Tom C. Hobman, François Jean, Jeffrey B. Joy, Andrew S. Lang, Sonya A. MacParland, Craig McCormick, Ryan S. Noyce, Rodney S. Russell, Selena M. Sagan, Jumari Snyman, Gabriela J. Rzeszutek, Mustafa S. Jafri, Isaac I. Bogoch, Jason Kindrachuk, Angela L. Rasmussen

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensSchwartz/Reisman Emergency Medicine InstituteMemorial University of NewfoundlandAIDS VancouverUniversity of British ColumbiaUniversité LavalUniversity of AlbertaToronto General HospitalUniversity of TorontoDalhousie UniversityUniversity of SaskatchewanUniversity of New BrunswickUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésVirologyVirusGeographyBusinessMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Highly pathogenic avian influenza (HPAI) H5N1 has caused the deaths of more than 100 million birds since 2021, and human cases since 1997 have been associated with significant morbidity and mortality. Given the recent detection of HPAI H5N1 in dairy cattle and H5N1 RNA detections in pasteurized retail milk in the United States, we established the Pan-Canadian Milk (PCM) Network. Through our network of collaborators from across Canada, retail milk is being procured longitudinally and sent to a central laboratory for testing for the presence of influenza A virus RNA. To date (05 July 2024), we have tested 92 retail milk samples from all ten Canadian provinces (NL, NS, PEI, NB, QC, ON, MB, SK, AB, and BC) and all have tested negative for influenza A virus RNA. Testing is ongoing and these results will be updated on rolling basis as additional data becomes available. Despite no known HPAI infections of dairy cattle in Canada to date, H5N1 poses a significant threat to the health of both humans and other animals. Routine surveillance of retail milk on a national scale will allow for monitoring of infected dairy cattle on an ongoing basis in a cost-effective, standardized, scalable and easily accessible manner. Our network and testing will act as an early detection system to help inform containment and mitigation activities if positive samples are identified.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,116

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,116
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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