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Enregistrement W4399173681 · doi:10.1016/j.cell.2024.04.041

A pseudoautosomal glycosylation disorder prompts the revision of dolichol biosynthesis

2024· article· en· W4399173681 sur OpenAlexafffund
Matthew P. Wilson, Takfarinas Kentache, Charlotte R. Althoff, Céline Schulz, Geoffroy de Bettignies, Loreta Cimbalistienė, Birutė Burnytė, Grace Yoon, Gregory Costain, Sandrine Vuillaumier‐Barrot, David Cheillan, Daisy Rymen, Lucie Rychtárová, Hana Hansíková, Marina Bury, Joseph P. Dewulf, Francesco Caligiore, Jaak Jaeken, Vincent Cantagrel, Emile Van Schaftingen, Gert Matthijs, François Foulquier, Guido T. Bommer

Notice bibliographique

RevueCell · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesHorizon 2020 Framework ProgrammeSickkids Research InstituteHospital for Sick ChildrenFonds De La Recherche Scientifique - FNRSMizutani Foundation for GlycoscienceAgence Nationale de la RechercheFonds Wetenschappelijk OnderzoekWalloon excellence in life sciences and biotechnologyMcLaughlin Centre, University of TorontoMarie CurieH2020 European Research CouncilCentre National de la Recherche ScientifiqueFonds Baillet LatourEuropean Resuscitation CouncilKU LeuvenFondation Médicale Reine ElisabethUniversité Catholique de Louvain
Mots-clésDolicholBiologyPseudoautosomal regionGlycosylationBiosynthesisBiochemistryGeneGlycosyltransferaseReductaseEnzymeGeneticsX chromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dolichol is a lipid critical for N-glycosylation as a carrier for activated sugars and nascent oligosaccharides. It is commonly thought to be directly produced from polyprenol by the enzyme SRD5A3. Instead, we found that dolichol synthesis requires a three-step detour involving additional metabolites, where SRD5A3 catalyzes only the second reaction. The first and third steps are performed by DHRSX, whose gene resides on the pseudoautosomal regions of the X and Y chromosomes. Accordingly, we report a pseudoautosomal-recessive disease presenting as a congenital disorder of glycosylation in patients with missense variants in DHRSX (DHRSX-CDG). Of note, DHRSX has a unique dual substrate and cofactor specificity, allowing it to act as a NAD + -dependent dehydrogenase and as a NADPH-dependent reductase in two non-consecutive steps. Thus, our work reveals unexpected complexity in the terminal steps of dolichol biosynthesis. Furthermore, we provide insights into the mechanism by which dolichol metabolism defects contribute to disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,308
Score d'incertitude au seuil0,237

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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