Synchronization of in vivo <scp>MacoNPV</scp>‐A baculovirus infection by analysis of individual <i>Mamestra configurata</i> larval guts
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Many studies have examined the gene expression of baculoviruses during host infection by infecting cultured insect host cells; however, only a few have attempted to characterize the interaction between baculoviruses and insect larvae, which more accurately models the virus‐insect relationship. The greatest challenge in assessing gene expression profiles in vivo in the larval gut is the lack of infection synchronization compared to cultured cells. Working with bertha armyworm, Mamestra configurata , larvae infected with the baculovirus Mamestra configurata nucleopolyhedrovirus‐A (MacoNPV‐A), viral gene expression was measured using droplet‐digital PCR, showing that the rate of infection in individual insects varies extremely widely. Subsequent RNA‐Seq of individual guts revealed that gene expression patterns were consistent in individuals with similar levels of viral gene expression. Therefore, the best approach for analysing baculovirus gene expression in vivo is to use the expression of an early viral gene as a means to select individuals that are closely matched in infection progress to produce the most synchronized infection cohorts for measuring gene expression profiles. In this way, a profile of gene expression was identified very early in infection that would have been masked by the activity of a few very robustly infected individuals present in sample pools made up of multiple individuals.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».