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Enregistrement W4399213047 · doi:10.1101/2024.05.31.596776

PEX14 functions as a molecular link between optineurin and pexophagy in human cells

2024· preprint· en· W4399213047 sur OpenAlexfundno aff
Hongli Li, Suyuan Chen, Celien Lismont, Bram Vandewinkel, Mohamed A. F. Hussein, Cláudio F. Costa, Dorien Imberechts, Yiyang Liu, Jorge E. Azevedo, Wim Vandenberghe, Steven H. L. Verhelst, Myriam Baes, Marc Fransen

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthKU LeuvenUniversity of TorontoUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignUniversiteit van Amsterdam
Mots-clésOptineurinInterface (matter)Cell biologyCellChemistryBiologyAutophagyGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pexophagy, the selective degradation of peroxisomes, is essential for removing excess or dysfunctional peroxisomes, and its dysregulation is linked to various diseases. Previous research has shown that optineurin (OPTN), an autophagy receptor involved in mitophagy, aggrephagy, and xenophagy, can induce pexophagy in HEK-293 cells. However, the underlying mechanism remains unclear. In this study, we used proximity labeling to identify PEX14, a peroxisomal membrane protein, as a neighboring partner of OPTN. Biochemical analyses revealed that PEX14 and OPTN interact through their respective coiled-coil and ubiquitin-binding domains. Further analyses demonstrated that the C-terminal half of overexpressed OPTN triggers pexophagy, likely by forming oligomers with endogenous OPTN. The co-localization of PEX14-OPTN complexes with LC3, combined with the suppression of OPTN-mediated peroxisome degradation by bafilomycin A1, supports a model in which PEX14 acts as a docking site for OPTN on the peroxisomal membrane, enabling the recruitment of the autophagic machinery for OPTN-mediated pexophagy. Summary This study uncovers and defines the peroxisomal membrane protein PEX14 as a key player in optineurin-driven pexophagy, advancing our mechanistic understanding of this cellular process. These findings open new avenues for developing therapeutic strategies targeting diseases associated with defective pexophagy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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