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Enregistrement W4399280155 · doi:10.1101/2024.06.01.24308323

Prompting is all you need: LLMs for systematic review screening

2024· preprint· en· W4399280155 sur OpenAlexaff
Christian Cao, Jason C. Sang, Rohit Arora, Robbie Kloosterman, Matt Cecere, Jaswanth Gorla, Richard Saleh, David Chen, Ian R. Drennan, Bijan Teja, Michael G. Fehlings, Paul E. Ronksley, Alexander A. C. Leung, Dany E. Weisz, Mairead Whelan, D. B. Emerson, Rahul K. Arora, Niklas Bobrovitz

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of CalgarySunnybrook Health Science CentreVector InstituteSouth Health CampusUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Systematic reviews (SRs) are the highest standard of evidence, shaping clinical practice guidelines, policy decisions, and research priorities. However, their labor-intensive nature, including an initial rigorous article screen by at least two investigators, delays access to reliable information synthesis. Here, we demonstrate that large language models (LLMs) with intentional prompting can match human screening performance. We introduce Framework Chain-of-Thought, a novel prompting approach that directs LLMs to systematically reason against predefined frameworks. We evaluated our prompts across ten SRs covering four common types of SR questions (i.e., prevalence, intervention benefits, diagnostic test accuracy, prognosis), achieving a mean accuracy of 93.6% (range: 83.3-99.6%) and sensitivity of 97.5% (89.7-100%) in full-text screening. Compared to experienced reviewers (mean accuracy 92.4% [76.8-97.8%], mean sensitivity 75.1% [44.1-100%]), our full-text prompt demonstrated significantly higher sensitivity in four reviews (p<0.05), significantly higher accuracy in one review (p<0.05), and comparable accuracy in two of five reviews (p>0.05). While traditional human screening for an SR of 7000 articles required 530 hours and $10,000 USD, our approach completed screening in one day for $430 USD. Our results establish that LLMs can perform SR screening with performance matching human experts, setting the foundation for end-to-end automated SRs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,254
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,094
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Communication savante, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMétarecherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,734
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2540,094
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0140,008
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0030,000
Science ouverte0,0050,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,742
Tête enseignante GPT0,543
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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