Nonenzymatic Hydration of Phosphoenolpyruvate: General Conditions for Hydration in Protometabolism by Searching Across Pathways
Notice bibliographique
Résumé
Numerous reactions within metabolic pathways have been reported to occur nonenzymatically, supporting the hypothesis that life began from a primitive nonenzymatic precursor to metabolism. However, most of those studies reproduce individual transformations or segments of pathways without providing a common set of conditions for classes of reactions that span multiple pathways. In this study, we search across pathways for common nonenzymatic conditions for a recurring chemical transformation in metabolism: alkene hydration. The mild conditions that we identify (Fe oxides such as green rust) apply to all hydration reactions of the rTCA cycle and gluconeogenesis, including the hydration of phosphoenolpyruvate (PEP) to 2-phosphoglycerate (2PGA), which had not previously been reported under nonenzymatic conditions. Mechanistic insights were obtained by studying analogous substrates and through anoxic and radical trapping experiments. Searching for nonenzymatic conditions across pathways provides a complementary strategy to triangulate conditions conducive to the nonenzymatic emergence of a protometabolism.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».