MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4399305103 · doi:10.1200/jco.2024.42.16_suppl.e23028

Reduced time to efficacy signals in advanced cancer trials using Chauhan weighted trajectory analysis.

2024· article· en· W4399305103 sur OpenAlexaff
Utkarsh Chauhan, Daylen Mackey, John R. Mackey

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineTrajectory

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

e23028 Background: As Kaplan-Meier (KM) analyzes single unidirectional endpoints, most advanced cancer randomized clinical trials (RCTs) are powered for a 10 endpoint of either progression free survival (PFS) or overall survival (OS). This disregards efficacy information carried by stable disease (SD), partial response (PR), and complete response (CR) that may precede progressive disease (PD) and death. Chauhan Weighted Trajectory Analysis (CWTA), a generalization of KM, permits simultaneous evaluation of multiple rank ordered endpoints. We hypothesized that using CWTA with all efficacy inputs could expedite RCT efficacy signals. Methods: We performed 100-fold simulations of RCTs in advanced cancer and determined the time to first significant efficacy signal (p < 0.05) for KM PFS and OS (logrank test) and CWTA (weighted logrank test). RCTs were stochastically generated at defined sample size (SS) allocated 1:1 to control or intervention and run for 60 months. Rank ordered health statuses were CR = 0, PR = 1, SD = 2, PD = 3, and Death = 4. All patients we assigned SD at time 0 and, each month, were capable of response (PR then CR), maintained SD, or irreversible exacerbation to PD or Death. Event probabilities were modified between groups as defined by a hazard ratio (HR). We modeled a control group CR rate of ~10% and a PR rate of ~50% to reflect first-line advanced cancer RCTs with a dropout rate of 10% over 60 months. At increments of SS and HR, we determined the mean and standard deviation of time-to-efficacy signals. Results: CWTA markedly reduced the time-to-efficacy signals when compared to KM PFS (23% to 67%) and KM OS (43% to 82%) (Table 1). Conclusions: CWTA, by incorporating the entirety of the cancer trajectory including disease response, progression, and death, meaningfully expedites the efficacy signals of cancer treatments compared to KM PFS and OS. We have previously reported CWTA increases trial power and reduces sample size requirements (Chauhan U, Zhao K, Walker J, Mackey JR; 2023. DOI: 10.3390/biomedinformatics3040052). Using CWTA rather than KM reduces trial duration, cost, and numbers of patients needed to evaluate therapies in advanced cancer, while reducing the regulatory risk inherent in powering a trial for a single KM primary endpoint. [Table: see text]

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,038
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,083
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,201

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0380,083
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,268
Tête enseignante GPT0,572
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical Oncology→Même sujetComputational Drug Discovery Methods→Travaux en français237 207→