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Enregistrement W4399333726 · doi:10.1101/2024.06.03.597229

Prominin-1 null Xenopus laevis develop subretinal drusenoid-like deposits, cone-rod dystrophy, and RPE atrophy

2024· preprint· en· W4399333726 sur OpenAlexaff
Brittany J. Carr, Dominic Skitsko, Jun Song, Zixuan Li, Myeong Jin Ju, Orson L. Moritz

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésXenopusRetinal pigment epitheliumDystrophyRetinaAnatomyRetinalBiologyOphthalmologyGeologyMedicineNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Mutations in the PROMININ-1 ( PROM1) gene are associated with inherited, non-syndromic vision loss. Here, we used CRISPR/Cas9 to induce truncating prom1 -null mutations in Xenopus laevis to create a disease model. We then tracked progression of retinal degeneration in these animals from the ages of 6 weeks to 3 years old. We found that retinal degeneration caused by prom1 -null is age-dependent and likely involves death or damage to the retinal pigment epithelium (RPE) that precedes photoreceptor degeneration. As prom1 -null frogs age, they develop large cellular debris deposits in the subretinal space and outer segment layer which resemble subretinal drusenoid deposits (SDD) in their location, histology, and representation in color fundus photography and optical coherence tomography (OCT). In older frogs, these SDD-like deposits accumulate in size and number, and they are present before retinal degeneration occurs. Evidence for an RPE origin of these deposits includes infiltration of pigment granules into the deposits, thinning of RPE as measured by OCT, and RPE disorganization as measured by histology and OCT. The appearance and accumulation of SDD-like deposits and RPE thinning and disorganization in our animal model suggests an underlying disease mechanism for prom1 -null mediated blindness of death and dysfunction of the RPE preceding photoreceptor degeneration, instead of direct effects upon photoreceptor outer segment morphogenesis, as was previously hypothesized.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,101
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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