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Enregistrement W4399344847 · doi:10.1071/sb23031

Embracing biodiversity: multispecies population genomics of leafless Bossiaea species shows novel taxa, population dynamics and conservation strategies

2024· article· en· W4399344847 sur OpenAlexfundno aff
Eilish S. McMaster, Jia‐Yee S. Yap, Keith L. McDougall, Elizabeth A. James, Neville G Walsh, Nic Jario, Jessica Peterie, Maurizio Rossetto

Notice bibliographique

RevueAustralian Systematic Botany · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMcMaster University
Mots-clésSystematic BotanyBiologyBiodiversityTaxonPopulation genomicsPopulationEvolutionary biologyGenomicsEcologyPlant geneticsSystematicsPlant taxonomyGenomeTaxonomy (biology)GeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Leafless Bossiaea species are a unique group of plants endemic to Australia that present intriguing challenges in taxonomy and conservation because of their morphological simplicity and often small, disjunct populations. We employed whole genome reduced representation sequencing (DArTseq) to enhance our understanding of the population dynamics, diversity and taxonomy of leafless Bossiaea species. Our dataset comprised 52,539 single-nucleotide polymorphisms across 283 samples from 7 leafless Bossiaea species, including 6 listed threatened species. We examined population structure, phylogenetic relationships, kinship and gene flow within and among populations. On the basis of our population-genomic analyses, we propose recognition of the novel taxon Bossiaea vombata subsp. orientalis and a change in status from species (B. milesiae) to subspecies for B. fragrans subsp. milesiae. Additionally, we show extensive clonal reproduction across species and limited gene flow at distances of >1 km, shedding light on the challenges faced by these species. We advocate a coordinated approach to conservation, focusing on restoring self-sustaining populations and leveraging genetic rescue strategies. By addressing the population dynamics of multiple species simultaneously in taxonomically challenging lineages, we can make informed choices to safeguard biodiversity and evolutionary potential.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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