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Enregistrement W4399350501 · doi:10.1136/bmjopen-2023-080746

European Autism GEnomics Registry (EAGER): protocol for a multicentre cohort study and registry

2024· article· en· W4399350501 sur OpenAlexaff
Madeleine Bloomfield, Alexandra Lautarescu, Síofra Heraty, Sarah N. Douglas, Pierre Violland, Roderik Plas, Anjuli Ghosh, Katrien Van den Bosch, Eliza Eaton, Michael Absoud, Roberta Battini, Nadia Bolshakova, Sven Bölte, Paolo Bonanni, Jacqueline Borg, Sara Calderoni, Rosa Calvo, Miguel Castelo‐Branco, Josefina Castro‐Fornieles, Pilar Caro, Freddy Cliquet, Alberto Danieli, Richard Delorme, Maurizio Elia, Maja Hempel, Claire S. Leblond, Nuno Madeira, Gráinne McAlonan, Roberta Milone, Ciara J. Molloy, Susana Mouga, Virginia Montiel, Ana Pina Rodrigues, Christian P. Schaaf, Mercedes Serrano, Kristiina Tammimies, Charlotte Tye, Federico Vigevano, Guiomar Oliveira, Benedetta Mazzone, Cara O’Neill, J. W. PENDER, Verena Romero, Julian Tillmann, Bethany Oakley, Declan Murphy, Louise Gallagher, Thomas Bourgeron, Chris Chatham, Tony Charman

Notice bibliographique

RevueBMJ Open · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAutism Spectrum Disorder Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoSickKids FoundationCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNIHR Maudsley Biomedical Research CentreInnovative Medicines InitiativeEuropean CommissionVetenskapsrådetMinistero della SaluteTuberous Sclerosis AssociationEpilepsy Research UKNational Institute for Health and Care ResearchKing's College LondonUK Research and InnovationGovernment of the United KingdomHORIZON EUROPE Framework ProgrammeAgence Nationale de la RechercheEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsAutism SpeaksSimons Foundation Autism Research Initiative
Mots-clésMedicineProtocol (science)Patient registryCohort studyFamily medicineEpidemiologyAutismCohortGenomicsMEDLINEDisease registryPediatricsAlternative medicinePathologyPsychiatryGenomeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Autism is a common neurodevelopmental condition with a complex genetic aetiology that includes contributions from monogenic and polygenic factors. Many autistic people have unmet healthcare needs that could be served by genomics-informed research and clinical trials. The primary aim of the European Autism GEnomics Registry (EAGER) is to establish a registry of participants with a diagnosis of autism or an associated rare genetic condition who have undergone whole-genome sequencing. The registry can facilitate recruitment for future clinical trials and research studies, based on genetic, clinical and phenotypic profiles, as well as participant preferences. The secondary aim of EAGER is to investigate the association between mental and physical health characteristics and participants' genetic profiles. METHODS AND ANALYSIS: EAGER is a European multisite cohort study and registry and is part of the AIMS-2-TRIALS consortium. EAGER was developed with input from the AIMS-2-TRIALS Autism Representatives and representatives from the rare genetic conditions community. 1500 participants with a diagnosis of autism or an associated rare genetic condition will be recruited at 13 sites across 8 countries. Participants will be given a blood or saliva sample for whole-genome sequencing and answer a series of online questionnaires. Participants may also consent to the study to access pre-existing clinical data. Participants will be added to the EAGER registry and data will be shared externally through established AIMS-2-TRIALS mechanisms. ETHICS AND DISSEMINATION: To date, EAGER has received full ethical approval for 11 out of the 13 sites in the UK (REC 23/SC/0022), Germany (S-375/2023), Portugal (CE-085/2023), Spain (HCB/2023/0038, PIC-164-22), Sweden (Dnr 2023-06737-01), Ireland (230907) and Italy (CET_62/2023, CEL-IRCCS OASI/24-01-2024/EM01, EM 2024-13/1032 EAGER). Findings will be disseminated via scientific publications and conferences but also beyond to participants and the wider community (eg, the AIMS-2-TRIALS website, stakeholder meetings, newsletters).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,067
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,070
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,113
Score d'incertitude au seuil0,378

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0670,070
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0040,005
Études des sciences et des technologies0,0040,002
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1130,035

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,127
Tête enseignante GPT0,457
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
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Résumé présentoui

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