The <i>Caenorhabditis elegans</i> bacterial microbiome influences microsporidia infection through nutrient limitation and inhibiting parasite invasion
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Microsporidia are eukaryotic obligate intracellular parasites that infect most animals including humans. To understand how the microbiome can impact microsporidia infection, we tested how bacterial isolates that naturally occur with Caenorhabditis elegans influence infection by the microsporidian Nematocida parisii . Nematodes exposed to two of these bacteria, Chryseobacterium scopthalmum and Sphingobacterium multivorum , exhibit reduced pathogen loads. Using untargeted metabolomics, we show that unsaturated fatty acid levels are disrupted by growth on these bacteria and that supplementation with the polyunsaturated fatty acid linoleic acid can restore full parasite growth in animals cultured on S. multivorum . We also found that two isolates, Pseudomonas lurida and Pseudomonas mendocina, secrete molecules that inactivate N. parisii spores. We determined that P. lurida inhibits N. parisii through the production of massetolides. We then measured 53 additional Pseudomonas strains, 64% of which significantly reduced N. parisii infection. A mixture of Pseudomonas species can greatly limit the amount of infection in C. elegans populations over many generations. Our findings suggest that interactions between bacteria and N. parisii are common and that these bacteria both modulate host metabolism and produce compounds that inhibit microsporidia infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».