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Enregistrement W4399390459 · doi:10.1038/s43856-024-00530-x

Mendelian randomization reveals interactions of the blood proteome and immunome in mitral valve prolapse

2024· article· en· W4399390459 sur OpenAlexafffund
Louis-Hippolyte Minvielle Moncla, Mewen Briend, Mame Sokhna Sylla, Samuel Mathieu, Anne Rufiange, Yohan Bossé, Patrick Mathieu

Notice bibliographique

RevueCommunications Medicine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Valve Diseases and Treatments
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec, Université LavalGovernment of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchUniversité Laval
Mots-clésBiologyMendelian randomizationCandidate geneMitral valve prolapseGenome-wide association studyImmunologyInternal medicineMedicineGeneticsGeneMitral valveSingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Mitral valve prolapse (MVP) is a common heart disorder characterized by an excessive production of proteoglycans and extracellular matrix in mitral valve leaflets. Large-scale genome-wide association study (GWAS) underlined that MVP is heritable. The molecular underpinnings of the disease remain largely unknown. METHODS: We interrogated cross-modality data totaling more than 500,000 subjects including GWAS, 4809 molecules of the blood proteome, and genome-wide expression of mitral valves to identify candidate drivers of MVP. Data were investigated through Mendelian randomization, network analysis, ligand-receptor inference and digital cell quantification. RESULTS: In this study, Mendelian randomization identify that 33 blood proteins, enriched in networks for immunity, are associated with the risk of MVP. MVP- associated blood proteins are enriched in ligands for which their cognate receptors are differentially expressed in mitral valve leaflets during MVP and enriched in cardiac endothelial cells and macrophages. MVP-associated blood proteins are involved in the renewal-polarization of macrophages and regulation of adaptive immune response. Cytokine activity profiling and digital cell quantification show in MVP a shift toward cytokine signature promoting M2 macrophage polarization. Assessment of druggability identify CSF1R, CX3CR1, CCR6, IL33, MMP8, ENPEP and angiotensin receptors as actionable targets in MVP. CONCLUSIONS: Hence, integrative analysis identifies networks of candidate molecules and cells involved in immune control and remodeling of the extracellular matrix, which drive the risk of MVP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,121
Score d'incertitude au seuil0,244

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,373
Écart entre enseignants0,349 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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