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Enregistrement W4399422441 · doi:10.1016/j.healun.2024.06.001

The CD8+ T cell content of transbronchial biopsies from patients with a first episode of clinically stable grade A1 cellular rejection is associated with future chronic lung allograft dysfunction

2024· article· en· W4399422441 sur OpenAlexafffund
Samuel A Beber, Sajad Moshkelgosha, Matthew T. White, May Cheung, David W. Hedley, Liran Levy, J. Samuels, Benjamin Renaud‐Picard, David H. Hwang, Tereza Martinu, Stephen Juvet

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Heart and Lung Transplantation · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTransplantation: Methods and Outcomes
Établissements canadiensToronto Rehabilitation InstituteSunnybrook Health Science CentreHealth Sciences CentreVancouver General HospitalToronto General HospitalUniversity Health Network
Organismes subventionnairesUniversity Health Network FoundationNational Institutes of Health
Mots-clésMedicineLung transplantationLungBiopsyLung biopsyCD8PathologyInfiltration (HVAC)Immune DysfunctionCardiologyInternal medicineImmune systemImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background T cells drive acute cellular rejection (ACR) and its progression to chronic lung allograft dysfunction (CLAD) following lung transplantation. International Society for Heart and Lung Transplantation grade A1 ACR without associated allograft dysfunction is often untreated, yet some patients develop progressive graft dysfunction. T-cell composition of A1 ACR lesions may have prognostic value; therefore, protein-level and epigenetic techniques were applied to transbronchial biopsy tissue to determine whether differential T-cell infiltration in recipients experiencing a first episode of stable grade A1 ACR (StA1R) is associated with early CLAD. Methods Sixty-two patients experiencing a first episode of StA1R were divided into those experiencing CLAD within 2 years ( n = 13) and those remaining CLAD-free for 5 or more years ( n = 49). Imaging mass cytometry (IMC) was used to profile the spectrum and distribution of intragraft T cell phenotypes on a subcohort ( n = 16; 8 early-CLAD and 8 no early-CLAD). Immunofluorescence was used to quantify CD4 + , CD8 + , and FOXP3 + cells. Separately, CD3 + cells were fluorescently labeled, micro-dissected, and the degree of Treg-specific demethylated region methylation was determined. Results PhenoGraph unsupervised clustering on IMC revealed 50 unique immune cell subpopulations. Methylation and immunofluorescence analyses demonstrated no significant differences in Tregs between early-CLAD and no early-CLAD groups. Immunofluorescence revealed that patients who developed CLAD within 2 years of lung transplantation showed greater CD8 + T cell infiltration compared to those who remained CLAD-free for 5 or more years. Conclusions In asymptomatic patients with a first episode of A1 rejection, greater CD8 + T cell content may be indicative of worse long-term outlook.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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