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Enregistrement W4399432024 · doi:10.1038/s41531-024-00729-8

Genome-wide determinants of mortality and motor progression in Parkinson’s disease

2024· article· en· W4399432024 sur OpenAlexaff
Manuela Tan, Michael Lawton, Miriam I. Pollard, Emmeline Brown, Raquel Real, Alejandro Martínez-Carrasco, Samir Bekadar, Edwin Jabbari, Regina H. Reynolds, Hirotaka Iwaki, Cornelis Blauwendraat, Sofia Kanavou, Leon Hubbard, Naveed Malek, Katherine A. Grosset, Nin Bajaj, Roger A. Barker, David J. Burn, Catherine Bresner, Thomas Foltynie, Nicholas Wood, Caroline H. Williams‐Gray, Ole A. Andreassen, Mathias Toft, Alexis Elbaz, Fanny Artaud, Alexis Brice, Jean‐Christophe Corvol, Jan Aasly, Matthew J. Farrer, Mike A. Nalls, Andrew Singleton, Nigel Williams, Yoav Ben‐Shlomo, John Hardy, Donald G. Grosset, Maryam Shoai, Lasse Pihlstrøm, Huw R. Morris

Notice bibliographique

Revuenpj Parkinson s Disease · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensCentre for Movement Disorders
Organismes subventionnairesHelse Sør-Øst RHFMedical Research CouncilNational Institutes of HealthHelse- og OmsorgsdepartementetParkinson's UKNIHR Cambridge Biomedical Research CentreWellcome TrustCure Parkinson’s Trust
Mots-clésParkinson's diseaseDiseaseLRRK2AlleleGenome-wide association studyLocus (genetics)MedicineBiologyBioinformaticsGeneticsSingle-nucleotide polymorphismGeneInternal medicineGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There are 90 independent genome-wide significant genetic risk variants for Parkinson's disease (PD) but currently only five nominated loci for PD progression. The biology of PD progression is likely to be of central importance in defining mechanisms that can be used to develop new treatments. We studied 6766 PD patients, over 15,340 visits with a mean follow-up of between 4.2 and 15.7 years and carried out genome-wide survival studies for time to a motor progression endpoint, defined by reaching Hoehn and Yahr stage 3 or greater, and death (mortality). There was a robust effect of the APOE ε4 allele on mortality in PD. We also identified a locus within the TBXAS1 gene encoding thromboxane A synthase 1 associated with mortality in PD. We also report 4 independent loci associated with motor progression in or near MORN1, ASNS, PDE5A, and XPO1. Only the non-Gaucher disease causing GBA1 PD risk variant E326K, of the known PD risk variants, was associated with mortality in PD. Further work is needed to understand the links between these genomic variants and the underlying disease biology. However, these may represent new candidates for disease modification in PD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,967

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,317 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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