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Enregistrement W4399447124 · doi:10.1101/2024.06.04.597374

The Fem Cell-surface Signaling System is Regulated by ExsA in <i>Pseudomonas aeruginosa</i> and Affects Pathogenicity

2024· preprint· en· W4399447124 sur OpenAlexaff
Yanqi Li, Sara Badr, Pansong Zhang, Lin Chen, Anjali Y. Bhagirath, Maryam Dadashi, Michael G. Surette, Kangmin Duan

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensMcMaster UniversityPopulation Health Research InstituteChildren's Hospital Research Institute of ManitobaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPseudomonas aeruginosaBiofilmQuorum sensingMicrobiologyVirulenceSecretionOperonBiologyType three secretion systemGalleria mellonellaActivator (genetics)PyocyaninPathogenicity islandCell biologyBacteriaGeneticsEscherichia coliGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Bacterial interspecies interactions shape the function and the structural dynamics of microbial communities and affect the progression of polymicrobial infections. The FemA-FemR-FemI (Fem) cell surface signaling system in Pseudomonas aeruginosa is known to be involved in the uptake of iron-chelating mycobactin produced by the Mycobacterium species. In this report, we present the data that indicates the femA -PA1909 operon was positively regulated by ExsA, a master regulator for the type three secretion system (T3SS), connecting the Fem system with T3SS. Intriguingly, the Fem system also influenced virulence factors in P. aeruginosa, including the quorum sensing systems, pyocyanin production, biofilm formation and the type six secretion systems (T6SSs). Using a Galleria mellonella infection model we observed that an femA deletion in PAO1 significantly increased the host survival rate while femI over-expression decreased it, suggesting a role for the Fem system in bacterial pathogenicity in vivo . Our data indicate the Fem system is a target of the T3SS master activator ExsA, and it affects P. aeruginosa pathogenicity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,186
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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