Abstract IA006: Synthetic lethalities for SWI/SNF mutant cancers
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Genes that encode subunits of SWI/SNF (BAF) chromatin remodeling complexes are mutated in over 20% of cancers. These include recurrent mutations of ARID1A (BAF250a) in ovarian, endometrioid, bladder, stomach, colorectal and pancreatic cancers and neuroblastoma; of the SMARCA4 (BRG1) subunit in medulloblastomas and non-small cell lung cancers; of the PBRM1 subunit in renal carcinomas; of the ARID2 subunit in hepatocellular, lung, and pancreas carcinomas as well as melanomas; of the BRD7 subunit in breast cancers. The SWI/SNF complex includes both core and lineage-specific subunits and utilizes the energy of ATP to modulate chromatin structure and regulate transcription. My laboratory began studying the SWI/SNF complex when SMARCB1 (INI1/SNF5/BAF47) became the first SWI/SNF subunit linked to tumor suppression when it was found to be biallelically inactivated in nearly all cases of a highly aggressive type of pediatric cancer called malignant rhabdoid tumor (MRT). Despite the extremely aggressive and lethal nature of MRT we have shown that these cancers are diploid and have remarkably simple genomes. We leverage this model tumor to identify how SWI/SNF complexes function, to determine how mutation of SWI/SNF subunits drive cancer and other diseases, and to identify therapeutic vulnerabilities that result from SWI/SNF mutations. We have leverage the Cancer Dependency Map, and the Pediatric Cancer Dependencies Accelerator, to systematically identify robust and impactful synthethic lethalities resulting from SWI/SNF mutations. These mechanisms and insights will be presented. Citation Format: Charles W.M. Roberts. Synthetic lethalities for SWI/SNF mutant cancers [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Expanding and Translating Cancer Synthetic Vulnerabilities; 2024 Jun 10-13; Montreal, Quebec, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Ther 2024;23(6 Suppl):Abstract nr IA006.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».