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Enregistrement W4399517104 · doi:10.1101/2024.06.10.598251

Translational profiling reveals novel gene expression changes in the direct and indirect pathways in a mouse model of LDOPA-induced dyskinesia

2024· preprint· en· W4399517104 sur OpenAlexaff
Sabika Jafri, Mahdi Ghani, Natalie Stickle, Carl Virtanen, Lili‐Naz Hazrati, Naomi P. Visanji

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNuclear Receptors and Signaling
Établissements canadiensMcGill UniversityOccupational Cancer Research CentreUniversity Health NetworkUniversity of TorontoOntario Brain InstituteDiscovery Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDirect pathway of movementDyskinesiaBiologyMedium spiny neuronGene expressionGene expression profilingStriatumMicroarrayCell biologyParkinson's diseaseGeneGeneticsNeuroscienceDopamineInternal medicineMedicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The molecular mechanisms underlying L-dihydroxyphenylalanine (LDOPA) induced dyskinesia in Parkinson’s disease are poorly understood. Here we employ two transgenic mouse lines, combining translating ribosomal affinity purification (TRAP) with bacterial artificial chromosome expression (Bac), to selectively isolate RNA from either DRD1A expressing striatonigral, or DRD2 expressing striatopallidal medium spiny neurons (MSNs) of the direct and indirect pathways respectively, to study changes in translational gene expression following repeated LDOPA treatment. 6-OHDA lesioned DRD1A and DRD2 BacTRAP mice were treated with either saline or LDOPA bi-daily for 21 days over which time they developed abnormal involuntary movements reminiscent of dyskinesia. On day 22, all animals received LDOPA 40 minutes prior to sacrifice. The striatum of the lesioned hemisphere was dissected and subject to TRAP. Extracted ribosomal RNA was amplified, purified and gene expression was quantified using microarray. 195 significantly varying transcripts were identified among the 4 treatment groups. Pathway analysis revealed an overrepresentation of calcium signaling and long-term potentiation in the DRD1A expressing MSNs of the direct pathway, with significant involvement of long-term depression in the DRD2 expressing MSNs of the indirect pathway following chronic treatment with LDOPA. Several MAPK associated genes ( NR4A1 , GADD45G , STMN1 , FOS and DUSP1 ) differentiated the direct and indirect pathways following both acute and chronic LDOPA treatment. However, the MAPK pathway activator PAK1 was downregulated in the indirect pathway and upregulated in the direct pathway, strongly suggesting a role for PAK1 in regulating the opposing effects of LDOPA on these two pathways in dyskinesia. Future studies will assess the potential of targeting these genes and pathways to prevent the development of LDOPA-induced dyskinesia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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