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Enregistrement W4399595582 · doi:10.1142/s1088424624500305

Hemoglobin’s β-subunit is primed to synergize oxygen delivery with nitric oxide-mediated increased blood flow

2024· article· en· W4399595582 sur OpenAlexaff
Maria S. Shadrina, Julie Laterreur, Gilles H. Peslherbe

Notice bibliographique

RevueJournal of Porphyrins and Phthalocyanines · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHemoglobin structure and function
Établissements canadiensConcordia UniversityPROTEO
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryNitric oxideProtein subunitHemoglobinOxygenOxygen deliveryBlood flowBiophysicsPharmacologyPhotochemistryBiochemistryInternal medicineOrganic chemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hemoglobin (Hb) undergoes a well-documented R[Formula: see text]T quaternary transition from a high [Formula: see text] affinity R state to a low [Formula: see text] affinity T state to optimize [Formula: see text] delivery to tissues. Also, red blood cells (RBCs) release a nitrovasodilator that increases blood flow to boost [Formula: see text] delivery. Hb’s R[Formula: see text]T transition coordinates its [Formula: see text] desaturation and RBC nitrovasodilator release by much-debated mechanisms. Here we investigate the allosterically controlled [Formula: see text]-nitrosation of Hb at its conserved βCys93 (i.e., SNO-Hb formation) for nitrovasodilator release. First, we examined NO[Formula: see text]/deoxyHb (HbFeII) incubations following aeration to mimic RBC NO production by the nitrite reductase activity of HbFeII and trapping of the nascent NO by βCys93 to give SNO-Hb on HbFeII conversion to oxyHb (HbFeO2). We confirmed SNO-Hb formation in the incubations with yields modulated by RBC antioxidant enzymes and [Formula: see text] but not CO. Since FeO2 hemes scavenge free NO, we hypothesized NO channeling within Hb and found by molecular dynamics simulations that most unligated NO molecules placed in the β-distal heme pocket (βDP) rapidly diffuse into a wide β-tunnel connecting the βDP to Hb’s central cavity and βCys93. Contraction of the central cavity brings NO closer to βCys93 in R-state plus βPhe71 and βTyr145 adopt conformations favorable to thiol access and SNO-Hb formation. In T-state, the SNO group is surface-exposed and destabilized to extrude NO. Thus, its structure, dynamics and conserved reactive thiol (βCys93) suggest that the β-subunit evolved to synergize [Formula: see text] and nitrovasoactivity delivery to tissues as a function of Hb [Formula: see text] saturation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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