Hemoglobin’s β-subunit is primed to synergize oxygen delivery with nitric oxide-mediated increased blood flow
Notice bibliographique
Résumé
Hemoglobin (Hb) undergoes a well-documented R[Formula: see text]T quaternary transition from a high [Formula: see text] affinity R state to a low [Formula: see text] affinity T state to optimize [Formula: see text] delivery to tissues. Also, red blood cells (RBCs) release a nitrovasodilator that increases blood flow to boost [Formula: see text] delivery. Hb’s R[Formula: see text]T transition coordinates its [Formula: see text] desaturation and RBC nitrovasodilator release by much-debated mechanisms. Here we investigate the allosterically controlled [Formula: see text]-nitrosation of Hb at its conserved βCys93 (i.e., SNO-Hb formation) for nitrovasodilator release. First, we examined NO[Formula: see text]/deoxyHb (HbFeII) incubations following aeration to mimic RBC NO production by the nitrite reductase activity of HbFeII and trapping of the nascent NO by βCys93 to give SNO-Hb on HbFeII conversion to oxyHb (HbFeO2). We confirmed SNO-Hb formation in the incubations with yields modulated by RBC antioxidant enzymes and [Formula: see text] but not CO. Since FeO2 hemes scavenge free NO, we hypothesized NO channeling within Hb and found by molecular dynamics simulations that most unligated NO molecules placed in the β-distal heme pocket (βDP) rapidly diffuse into a wide β-tunnel connecting the βDP to Hb’s central cavity and βCys93. Contraction of the central cavity brings NO closer to βCys93 in R-state plus βPhe71 and βTyr145 adopt conformations favorable to thiol access and SNO-Hb formation. In T-state, the SNO group is surface-exposed and destabilized to extrude NO. Thus, its structure, dynamics and conserved reactive thiol (βCys93) suggest that the β-subunit evolved to synergize [Formula: see text] and nitrovasoactivity delivery to tissues as a function of Hb [Formula: see text] saturation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».