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Enregistrement W4399602478 · doi:10.2196/55632

It Is in Our DNA: Bringing Electronic Health Records and Genomic Data Together for Precision Medicine

2024· article· en· W4399602478 sur OpenAlexvenueno aff
Alan J. Robertson, Andrew Mallett, Zornitza Stark, Clair Sullivan

Notice bibliographique

RevueJMIR Bioinformatics and Biotechnology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPrecision medicineWorkflowData sciencePoint of careClinical decision support systemGenomic medicineComputer scienceGenomic informationHealth carePersonalized medicineDigital healthMedical recordBig dataData miningMedicineBioinformaticsDecision support systemComputational biologyGenomeBiologyPathologyDatabase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Health care is at a turning point. We are shifting from protocolized medicine to precision medicine, and digital health systems are facilitating this shift. By providing clinicians with detailed information for each patient and analytic support for decision-making at the point of care, digital health technologies are enabling a new era of precision medicine. Genomic data also provide clinicians with information that can improve the accuracy and timeliness of diagnosis, optimize prescribing, and target risk reduction strategies, all of which are key elements for precision medicine. However, genomic data are predominantly seen as diagnostic information and are not routinely integrated into the clinical workflows of electronic medical records. The use of genomic data holds significant potential for precision medicine; however, as genomic data are fundamentally different from the information collected during routine practice, special considerations are needed to use this information in a digital health setting. This paper outlines the potential of genomic data integration with electronic records, and how these data can enable precision medicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,054
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,108
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,285

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0540,108
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0070,009
Études des sciences et des technologies0,0030,009
Communication savante0,0190,033
Science ouverte0,0030,012
Intégrité de la recherche0,0070,013
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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