Molecular residual disease (MRD) detection using bespoke circulating tumor DNA (ctDNA) assays in localized soft tissue sarcoma (STS): A multicenter study.
Notice bibliographique
Résumé
11537 Background: Surgery and (neo)adjuvant radiotherapy (RT) are the mainstay curative treatments for localized STS. Despite treatment, up to 50% of STS patients experience metastatic relapse, and routine use of adjuvant systemic therapy (AST) remains controversial. The presence of ctDNA following curative-intent treatment of STS is a potential biomarker for MRD and may identify patients who are likely to benefit from AST. Given the genomic heterogeneity of STS, a histology-agnostic approach to ctDNA detection in this population is desirable. Methods: This multicentre prospective study enrolled patients with localized, high-risk (grade ≥ 2, size ≥ 5 cm) STS. Blood samples were collected at diagnosis, post- radiotherapy, post-surgery, and at serial longitudinal time points for up to 2 years. Standard radiologic follow-up was performed concurrently. Whole exome sequencing of tumor tissue was carried out to identify patient-specific, single nucleotide variants. Personalized, and tumor-informed multiplex PCR next-generation sequencing-based ctDNA (Signatera) assays were used to track ctDNA in serial plasma samples. The primary endpoint was ctDNA detection rate of >70% at diagnosis. Secondary endpoints were MRD detection after local therapy and correlation of ctDNA detection with disease relapse. Results: A total of 76 subjects (female n = 43; median age [range]: 58 [21- 84] years) were included in this study from Princess Margaret Cancer Center, Stanford University, and Emory University. The most common STS types observed were leiomyosarcoma (LMS, n = 28), liposarcoma (n = 14), (predominantly dedifferentiated [n = 6]), and myxofibrosarcoma (n = 11). Among 38 pts who had blood samples collected at baseline (time of surgery), ctDNA was positive in 30/38 (79%). A baseline sample prior to radiotherapy was collected in 24 pts. Following neoadjuvant radiotherapy, 8/24 pts (33%) who were ctDNA positive at baseline became ctDNA negative, while 29/30 became ctDNA-negative after surgical resection. Median follow-up was 19 months, and 19/76 pts (25%) experienced disease recurrence Among these 19 pts, ctDNA was detected in all pts with baseline studies. ctDNA was detected at or before radiologic recurrence in 9/19 pts (47%), predominantly LMS 4/9, with a median lead time of 64.8 days (range: 0-197 days). ctDNA was detected in 14/38 patients at baseline with no radiological recurrence during follow-up period. Conclusions: Personalized, tumor-informed ctDNA assays can detect MRD and has prognostic value after definitive therapy, surgery and (neo)adjuvant radiotherapy, in localized STS patients. Additional studies are ongoing to evaluate ctDNA as a predictive biomarker for benefit from AST in STS. Clinical trial information: NCT03818412 .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».