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Enregistrement W4399652826 · doi:10.1101/2024.06.12.598646

A mechanism for telomere-specific telomere length regulation

2024· preprint· en· W4399652826 sur OpenAlexaff
Gabriela M. Teplitz, Emeline Pasquier, Erin Bonnell, Evelina De Laurentiis, Louise Bartle, Jean‐François Lucier, Raymund J. Wellinger

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTelomereTelomeraseSubtelomereTelomere-binding proteinBiologyHeterochromatinGeneticsChromosomeSenescenceCell divisionDNACell biologyChromatinGeneCellDNA-binding proteinTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY Telomere length is a critical determinant of telomere function and hence chromosome stability. Critically short telomeres induce cellular senescence and division arrest, which eventually may lead to devastating age-related degenerative diseases. Conversely, maintenance of telomere length is a hallmark of cancer. How telomere set-length is established and molecular mechanisms for telomere-specific length regulation remained unknown. Here we detail a mechanism of a telomere-specific set-length regulation that causes drastic differences in telomere length between individual telomeres in the same cell. Indeed, the results show that telomerase recruitment is modulated in cis in a telomere-specific way. Increased Sir4 abundance on yeast TEL03L subtelomeric heterochromatin leads to a set-length maintenance that is two to three times higher than on any other telomere. Remarkably, the distal 15 kb of TEL03L are sufficient to transfer this telomere specific set-length regulation to another chromosome. Furthermore, a mutation in the telomere boundary element protein Tbf1 allows increased Sir4 binding on all telomeres and hence results in longer set-lengths. The results therefore will force a rethinking of telomere length regulation away from the generalized view that all telomeres are treated the same to a more telomere-specific treatment. HIGHLIGHTS Regulation of the set-length of telomeric repeats is telomere-specific. TEL03L on yeast chromosome III displays a set-length regulation that confers an extremely long repeat tract. Transferring the distal part of TEL03L onto chromosome XV is sufficient to impose the very long set-length regulation. Telomere-specific tract set-length regulation depends on the alternate telomerase recruitment pathway involving Sir4 and yKU and the chromatin boundary protein Tbf1. GRAPHICAL ABSTRACT

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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