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Enregistrement W4399664541 · doi:10.3138/jammi-2023-0036

Brainstorm: A case of granulomatous encephalitis

2024· article· en· W4399664541 sur OpenAlexaffvenue
Patrick Benoit, Stephanie Wang, Catherine Wang, Arpita Chakravarti, Julian A. Villalba, Ibne Karim M. Ali, Shantanu Roy, Sarah GH Sapp, Sarah Reagan-Steiner, Kristoff Nelson, Romain Cayrol, Me‐Linh Luong, Sophie Grand’Maison, Michaël Desjardins

Notice bibliographique

RevueJournal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLegionella and Acanthamoeba research
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesCenters for Disease Control and Prevention
Mots-clésBrainstormingEncephalitisMedicineComputer scienceVirologyArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Free-living amoebas (FLAs) can cause severe and fatal central nervous system infections that are difficult to diagnose. Methods: We present the case of a 74-year-old immunocompetent woman admitted for focal neurological symptoms with enhancing lesions in the right cerebellar hemisphere. A first cerebral biopsy showed granulomatous inflammation, but no microorganisms were identified. After transient clinical improvement, she eventually deteriorated 4 months after initial presentation, with an MRI confirming multiple new masses affecting all cerebral lobes. Results: A second brain biopsy revealed granulomatous and acute inflammation with organisms containing a large central nucleus with prominent karyosome, consistent with FLAs. Immunohistochemical and polymerase chain reaction assays performed at CDC were positive for Acanthamoeba spp, confirming the diagnosis of granulomatous amoebic encephalitis (GAE) caused by Acanthamoeba spp. The patient was treated with combination therapy recommended by CDC, but died a few days later. Upon histopathological rereview, amoebic cysts and trophozoites were identified by histochemical and immunohistochemical methods in the first cerebral biopsy. Conclusion: FLA infections can be challenging to diagnose because of the low incidence, non-specific clinical and radiological presentation, lack of accessible diagnostic tools, and clinicians’ unfamiliarity. This case highlights the importance of recognizing FLA as a potential cause of granulomatous encephalitis, even in the absence of risk factors, as early treatment might be associated with favourable outcomes in case reports. When suspected, CDC laboratories offer tests to confirm the diagnosis promptly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0030,002
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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