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Enregistrement W4399671788 · doi:10.1038/s41467-024-49425-4

The effector-triggered immunity landscape of tomato against Pseudomonas syringae

2024· article· en· W4399671788 sur OpenAlexafffund
Fabien Lonjon, Yan Lai, Nasrin Askari, Niharikaa Aiyar, Cedoljub Bundalovic-Torma, Bradley Laflamme, Pauline W. Wang, Darrell Desveaux, David S. Guttman

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Parasitism and Resistance
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMitacsScience Foundation Ireland
Mots-clésPseudomonas syringaeEffectorBiologyVirulenceSolanumPlant ImmunityArabidopsisArabidopsis thalianaPathogenCropBiotechnologyBotanyMicrobiologyAgronomyGeneticsGeneMutantCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tomato (Solanum lycopersicum) is one of the world's most important food crops, and as such, its production needs to be protected from infectious diseases that can significantly reduce yield and quality. Here, we survey the effector-triggered immunity (ETI) landscape of tomato against the bacterial pathogen Pseudomonas syringae. We perform comprehensive ETI screens in five cultivated tomato varieties and two wild relatives, as well as an immunodiversity screen on a collection of 149 tomato varieties that includes both wild and cultivated varieties. The screens reveal a tomato ETI landscape that is more limited than what was previously found in the model plant Arabidopsis thaliana. We also demonstrate that ETI eliciting effectors can protect tomato against P. syringae infection when the effector is delivered by a non-virulent strain either prior to or simultaneously with a virulent strain. Overall, our findings provide a snapshot of the ETI landscape of tomatoes and demonstrate that ETI can be used as a biocontrol treatment to protect crop plants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,793
Score d'incertitude au seuil0,417

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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