Fecal sampling protocol to assess bumble bee health in conservation research
Notice bibliographique
Résumé
An increasing number of wild bee species are declining or threatened with extinction worldwide. Decline has been proposed to be caused by a combination of threats, including increasing wild bee disease prevalence and pathogen spillover from managed bees that can reduce health of wild bees. Most approaches aiming at characterizing bee health, however, require sacrificing tens to hundreds of individual bees per site or species, with reports of several thousand individuals collected per study. Considering the widespread need to assess bee health, this sampling approach is not sustainable, especially for endangered populations or species. Here, we present a non-destructive protocol to collect bumble bee faeces and assess parasite loads of wild-caught individuals. The standard protocol consists of net-capturing individual bumble bees and placing them in a 10 cm (diameter) petri dish to collect faeces. This fecal screening approach is frequently used in laboratory settings, but much less in the field, which can impair conservation research. When placing bumble bees in a previously refrigerated cooler, we successfully collected faeces for 86% individuals, while the standard protocol, as used in laboratory settings, yielded 76% success in collecting faeces. We also identified cells and spores of two common gut parasites Crithidia spp. and Vairimorpha spp. in faecal samples. The faecal sampling presented here opens future avenues to assess bee pathogen loads using molecular techniques, while collected faeces could also be used to assess bee health more broadly, including bee microbiota and bee diet.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,017 | 0,009 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».