MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4399709057 · doi:10.1101/2024.06.11.598535

Mistranslating tRNA variants have anticodon- and sex-specific impacts on <i>Drosophila melanogaster</i>

2024· preprint· en· W4399709057 sur OpenAlexafffund
Joshua Isaacson, Matthew D. Berg, Jessica Jagiello, William S.B. Yeung, Brendan Charles, Judit Villén, Christopher J. Brandl, Amanda J. Moehring

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of Health
Mots-clésTransfer RNADrosophila melanogasterGeneticsBiologyEvolutionary biologyDrosophila (subgenus)RNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Transfer RNAs (tRNAs) are vital in determining the specificity of translation. Mutations in tRNA genes can result in the misincorporation of amino acids into nascent polypeptides in a process known as mistranslation. Since mistranslation has different impacts, depending on the type of amino acid substitution, our goal here was to compare the impact of different mistranslating tRNA Ser variants on fly development, lifespan, and behaviour. We established two mistranslating fly lines, one with a tRNA Ser variant that misincorporates serine at valine codons (V➔S) and the other that misincorporates serine at threonine codons (TàS). While both mistranslating tRNAs increased development time and developmental lethality, the severity of the impacts differed depending on amino acid substitution and sex. The V➔S variant extended embryonic, larval, and pupal development whereas the T➔S only extended larval and pupal development. Females, but not males, containing either mistranslating tRNA presented with significantly more anatomical deformities than controls. Mistranslating females also experienced extended lifespan whereas mistranslating male lifespan was unaffected. In addition, mistranslating flies from both sexes showed improved locomotion as they aged, suggesting delayed neurodegeneration. Therefore, although mistranslation causes detrimental effects, we demonstrate that mistranslation also has positive effects on complex traits such as lifespan and locomotion. This has important implications for human health given the prevalence of tRNA variants in humans. PLAIN LANGUAGE SUMMARY Mutant tRNA genes can cause mistranslation, the misincorporation of amino acids into proteins, and are associated with several human diseases. This study investigated the role of two tRNA variants that cause threonine-to-serine (T➔S) or valine-to-serine (V➔S) substitution. Both variants caused developmental delays and lethality in both sexes and increase prevalence of deformities in females. Surprisingly, female T➔S and V➔S flies experienced increased lifespan and mistranslating males and females showed improved locomotion. These results suggest that mistranslation has both positive and negative effects that depend on the tRNA variant and sex of the fly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetRNA modifications and cancerTravaux en français237 207