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Enregistrement W4399757194 · doi:10.1101/2024.06.14.24308946

Genome-wide association studies of lifetime and frequency cannabis use in 131,895 individuals

2024· preprint· en· W4399757194 sur OpenAlexafffund
Hayley H. A. Thorpe, Pierre Fontanillas, John J. Meredith, Mariela Jennings, Renata B. Cupertino, Shreya Pakala, Sarah L. Elson, Jibran Y. Khokhar, Lea K. Davis, Emma C. Johnson, Abraham A. Palmer, Sandra Sanchez‐Roige

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCannabis and Cannabinoid Research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthVanderbilt University Medical CenterVanderbilt UniversityNational Institute on Drug AbuseTobacco-Related Disease Research Program
Mots-clésCannabisGenome-wide association studyAssociation (psychology)Genetic associationGeneticsPsychologyBiologyPsychiatrySingle-nucleotide polymorphismGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Cannabis is one of the most widely used drugs globally. Decriminalization of cannabis is further increasing cannabis consumption. We performed genome-wide association studies ( GWASs ) of lifetime ( N= 131,895) and frequency ( N= 73,374) of cannabis use. Lifetime cannabis use GWAS identified two loci, one near CADM2 (rs11922956, p =2.40E-11) and another near GRM3 (rs12673181, p =6.90E-09). Frequency of use GWAS identified one locus near CADM2 (rs4856591, p =8.10E-09; r 2 =0.76 with rs11922956). Both traits were heritable and genetically correlated with previous GWASs of lifetime use and cannabis use disorder ( CUD ), as well as other substance use and cognitive traits. Polygenic scores ( PGSs ) for lifetime and frequency of cannabis use associated cannabis use phenotypes in AllofUs participants. Phenome-wide association study of lifetime cannabis use PGS in a hospital cohort replicated associations with substance use and mood disorders, and uncovered associations with celiac and infectious diseases. This work demonstrates the value of GWASs of CUD transition risk factors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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