MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4399792961 · doi:10.1101/2024.06.17.599257

Stability of four carbapenem antibiotics in discs used for antimicrobial susceptibility testing

2024· preprint· en· W4399792961 sur OpenAlexfundno aff
Selvi N. Shahab, Michiel L. Bexkens, Nikita Kempenaars, Amber Rijfkogel, Anis Karuniawati, Martine De Vos, Wil H. F. Goessens, Juliëtte A. Severin

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntibiotics Pharmacokinetics and Efficacy
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDeltaresZonMwInternational Development Research CentreJoint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance
Mots-clésAntibioticsAntimicrobialCarbapenemMicrobiologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT In low-to middle-income countries, microbiological laboratories often use disc diffusion for antimicrobial susceptibility testing (AST). Reliable AST of carbapenem antibiotics is crucial for treatment decisions and surveillance purposes. Transport and storage conditions of materials used for AST are critical and may be challenging in some settings, where temperature cannot always be controlled. This study aimed to test the stability of four carbapenems in discs for AST under unfavourable conditions, i . e ., at room temperature and 35°C for up to 72 hours. Imipenem, meropenem, ertapenem, and doripenem discs from three brands, Oxoid, Becton Dickinson, and HiMedia, containing 10 μg of antibiotic were included. Discs were exposed to six unfavourable conditions and the recommended storage-condition as control. Subsequently, disc diffusion testing following the EUCAST guidelines was performed with four well-defined strains of Escherichia coli with different susceptibility profiles to carbapenems. The inhibition zone diameters were measured after 16-18 hours of incubation at 35±2°C. All experiments were executed in triplicate. In parallel, the carbapenems’ degradation was observed using a spectrophotometric method. Our study revealed that carbapenem discs were generally stable for AST although the concentration of most carbapenem antibiotics in discs decreased over time. Overall, imipenem (Oxoid and Becton Dickinson) discs were the most stable. Meropenem discs were less stable when exposed to 35°C than at room temperature. Concentrations of carbapenems in HiMedia discs were higher than those in Oxoid and Becton Dickinson. For carbapenem AST using disc diffusion in a rural area, we recommend using imipenem discs from Oxoid or Becton Dickinson. GRAPHICAL ABSTRACT HIGHLIGHTS In remote areas, transportation conditions of AST discs may be challenging Discs with four carbapenems from three brands were tested using six conditions Carbapenem discs were generally stable for AST In unfavourable conditions, concentrations in the discs degraded over time Imipenem (Oxoid and Becton Dickinson) discs were the most stable

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetAntibiotics Pharmacokinetics and EfficacyTravaux en français237 207