Patterns of prokaryotic activity along the marine planktonic matter continuum
Notice bibliographique
Résumé
Prokaryotic abundance and activity are commonly assessed by dividing them into two size-fractions: free-living and attached to particles. Nevertheless, organic matter, essential for the growth of heterotrophic prokaryotes, is present in the environment in a continuum of sizes, from purely dissolved to large particles. Therefore, defining the activity of the prokaryotic community would be more accurate by considering all the distinct size fractions. To achieve this, we measured prokaryotic abundance (PA), heterotrophic prokaryotic activity (as leucine incorporation) and extracellular enzyme activities at a coastal site in the NW Mediterranean Sea. We conducted measurements in both bulk seawater and size fractionated samples sequentially passing through 5 different filter types: 0.2-0.8-3-5-10 μm pore size. Our results indicate that the fraction <0.8 μm contained the highest percentage of cells (91.6 ± 1.1 %) and leucine incorporation rates (72.2 ± 3.5 %). Most of the extracellular enzyme activity appeared in the dissolved fraction (<0.2 μm; 19.8-79.4 %), yet the specific activity of the enzymes (per cell activity) was 100-1000 times higher in the particulate (>0.8 μm) than in the free-living (0.2-0.8 μm) fraction. The size fraction with highest specific activities for leucine incorporation and most of the enzyme activities (β-glucosidase, esterase, Leu-aminopeptidase and alkaline phosphatase) was the 5-10 μm fraction. In contrast, the higher specific chitobiase activity in the >10 μm fraction, suggests that the prokaryotic community colonizing large particles might be more specialized in the hydrolysis of organic matter of zooplanktonic origin than the community colonizing smaller particles.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».