MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4399823280 · doi:10.1101/2024.06.18.599571

The HUSH epigenetic repressor complex silences PML nuclear bodies-associated HSV-1 quiescent genomes

2024· preprint· en· W4399823280 sur OpenAlexaff
Simon Roubille, Tristan Escure, Franceline Juillard, Armelle Corpet, Rémi Néplaz, Olivier Binda, Coline Seurre, Mathilde Gonin, Stuart Bloor, Camille Cohen, Pascale Texier, Oscar Haigh, Olivier Pascual, Yonatan Ganor, Frédérique Magdinier, Marc Labétoulle, Paul J. Lehner, Patrick Lomonte

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpigeneticsRepressorBiologyGenomeCell biologyGeneticsGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Herpes simplex virus 1 (HSV-1) latently infected neurons show multiple patterns in the distribution of the viral genomes within the nucleus, at least in mouse models. One of the major patterns is characterized by the presence of quiescent HSV-1 genomes trapped in promyelocytic leukemia nuclear bodies (PML NBs) to form viral DNA-containing PML-NBs (vDCP NBs). Using a cellular model reproducing the formation of vDCP NBs we previously showed that viral genomes are chromatinized with the H3.3 histone variant modified on its lysine 9 by tri-methylation (H3.3K9me3) a chromatin mark associated with transcriptional repression. Here we identify an essential role for the HUSH complex and its SETDB1 and MORC2 effectors in the acquisition of the H3K9me3 mark on the PML NBs-associated HSV-1 and in the maintenance of HSV-1 transcriptional repression. ChiP-seq analyses highlight the association of the H3K9me3 mark with the entire viral genome. Inactivating the HUSH-SETDB1-MORC2 repressor complex prior to viral infection results in a significant reduction of H3K9me3 on the viral genome, while the overall impact on the cellular genome is minimal, except for expected changes in families of LINE1 retroelements. Depletion of HUSH, SETDB1, or MORC2, relieves the repressive state of HSV-1 in infected primary human fibroblasts as well as human induced pluripotent stem cell-derived sensory neurons (hiPSDN). We discovered that the viral protein ICP0 induces MORC2 degradation via the proteasome machinery. This process is concurrent with ICP0 and MORC2 depletion capability to reactivate silenced HSV-1 in hiPSDN. Overall, our findings underscore the robust antiviral function of the HUSH-SETDB1-MORC2 repressor complex against a herpesvirus by modulating chromatin marks linked to repression, thus presenting promising avenues for novel anti-herpesvirus therapeutic strategies. Significance statement Herpes simplex virus 1 (HSV-1) is a major human pathogen, which remains latent in the trigeminal ganglia (TG) neurons of the infected individuals. Its reactivation is characterized by a variety of clinical symptoms the most severe ones being keratitis and herpesvirus encephalitis. The colonization of the CNS by the virus during the individual life is a well-known fact but the pathophysiological effects on neurons homeostasis are still underestimated. It is thus paramount to understand the molecular mechanisms that control HSV-1 latency and maintain the virus in a pseudo silent state.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetHerpesvirus Infections and Treatments→Travaux en français237 207→