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Enregistrement W4399850994 · doi:10.1016/j.nmni.2024.101444

Evaluation of MMV Pandemic Response Box compounds to identify potent compounds against clinically relevant bacterial and fungal clinical isolates in vitro

2024· article· en· W4399850994 sur OpenAlexaff
Seshan Sivasankar, B Appalaraju, Martin P. Grobusch, Sankarganesh Jeyaraj

Notice bibliographique

RevueNew Microbes and New Infections · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesMedicines for Malaria VentureIndian Council of Medical Research
Mots-clésIn vitroMicrobiologyPandemicBiologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)MedicineInfectious disease (medical specialty)PathologyBiochemistryDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multidrug resistant bacterial and fungal pathogens are resistant to a number of significant front-line drugs, hence, identification of new inhibitory agents to combat them is crucial. In this study, we aim to evaluate the activity of Pandemic Box compounds from Malaria Medicines Venture (MMV) against A. baumannii and P. aeruginosa bacterial, C. auris, C. albicans and A. niger fungal clinical isolates. Isolates were initially screened with 201 antibacterial and 46 antifungal compounds (10 μM) using a microbroth dilution in triplicates to determine MIC. A persister assay was performed for bacterial pathogens. Out of 201 antibacterial compounds, twenty-nine and seven compounds inhibited the growth of A. baumannii and P. aeruginosa at 10 μM, respectively. MMV1580854, MMV1579788, eravacycline and epetraborole inhibited both the bacterial test isolates. In a persister assay, MMV1634390 showed complete bactericidal effect against A. baumannii . With antifungal activity compounds, C. auris responded to15 compounds, Six compounds inhibited C. albicans and one was effective against A. niger at 10 μM. The ratio of Minimum Fungicidal Concentration (MFC): Minimum Inhibitory Concentration (MIC) of MMV1782110 was 2 against C . auris . Eberconazole, amorolfine and luliconazole are fungicidal targeting C. albicans at a MFC: MIC ratio of 2. Five compounds from MMV Pandemic Box were found to be inhibiting colistin and ceftazidime resistant A. baumannii clinical isolate, also against colistin and β-lactam resistant P. aeruginosa clinical isolate . MMV1634390 showed complete bactericidal effect against A. baumannii in a persister assay. MMV1782110, Eberconazole, amorolfine and luliconazole exhibited potent anti-fungal activity. Further investigations are warranted to identify the targets and mechanism. • MMV Pandemic Response Box compounds were evaluated against MDR bacterial and fungal pathogens isolated from patients. • MMV1634390 compound was highly bactericidal against A. baumannii , whereas eravacycline and epetraborole were against both A. baumannii and P. aeruginosa. • Few compounds were fungicidal against MDR Candida and Aspergillus fungal species. • A novel compound MMV1782110 showed excellent inhibitory activity against Candida auris .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,859
Score d'incertitude au seuil0,672

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,410
Écart entre enseignants0,338 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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