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Enregistrement W4399878238 · doi:10.5551/jat.ed267

Genetic Determinants of High-density Lipoprotein Cholesterol Efflux Capacity: Insights from Paraoxonase 1 Polymorphisms

2024· editorial· en· W4399878238 sur OpenAlexaboutno aff
Ryuji Toh

Notice bibliographique

RevueJournal of Atherosclerosis and Thrombosis · 2024
Typeeditorial
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueParaoxonase enzyme and polymorphisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésParaoxonaseEffluxPON1CholesterolAryldialkylphosphataseHigh-density lipoproteinGeneticsLipoproteinChemistryBiologyMedicineInternal medicineGeneBiochemistryEnzymeGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In recent years, it has been recognized that the quality, not just the quantity, of high-density lipoprotein (HDL) is important.Numerous studies have shown that the cholesterol efflux capacity (CEC) of HDL is a negative risk factor for cardiovascular disease independent of HDL cholesterol (HDL-C) levels 1,2) .Under conditions such as insulin resistance, oxidative stress, and chronic inflammation, changes in the composition of HDL components and posttranslational modifications of constituent proteins can impair HDL's anti-atherosclerotic effects 3) .However, according to a large-scale family-based population study, CEC is estimated to be 13% heritable and independent of HDL-C 4) .A genomewide association study (GWAS) conducted on 5,293 French-Canadian individuals identified significant genetic signals associated with CEC in 5 loci related to lipid biology, including CETP, LIPC, LPL, APOA1/C3/A4/A5, and APOE/C1/C2/C4, as well as near PPP1CB/PLB1 and RBFOX3/ENPP7.After adjusting for HDL-C and triglyceride levels, the remaining significant association was observed with genetic variants at the APOE/C1/C2/C4 locus 5) .In a GWAS involving 607 patients with coronary artery disease, the CDKAL1 locus was independently associated with CEC, distinct from HDL-C 6) .In addition, a GWAS of 4,981 patients with chronic kidney disease revealed associations between CEC and KLKB1 and CLSTN2 genes 7) .In contrast, endothelial lipase (EL), which preferentially hydrolyzes phospholipids in HDL, is encoded by the LIPG gene, and loss-of-function mutations in the LIPG gene have been shown to improve CEC alongside elevated HDL-C levels 8) .However, recent reports have identified pathogenic LIPG variants that impair the HDL function 9, 10) .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,219
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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