An optimized fluorescence assay for screening novel PARP-1 inhibitors
Notice bibliographique
Résumé
Poly(ADP-ribose) polymerase 1 (PARP-1) is an enzyme that catalyzes the formation of poly(ADP-ribose) (PAR) polymer chains from nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) onto target proteins. PARP-1 plays an important role as a first responder in DNA damage repair and has been an attractive target for the development of anti-cancer therapeutics. This has led to high interest in the development of novel small molecule therapeutics by researchers to target PARP-1 and other members of the PARP-family of enzymes. However, identifying ideal drug candidates can be problematic as current commercial PARP-1 screening assays are cost-prohibitive for many small drug discovery laboratories (particularly for academic groups) and may require specialized equipment or techniques that many labs are not equipped for. Herein, we present a robust, low-cost and optimized PARP-1 assay that quantifies leftover NAD+ substrate as a key readout for PARP-1 inhibition via conversion to a fluorophore, while simultaneously optimizing the assay for molecules that have high background fluorescence. The assay procedure has been validated with known PARP inhibitors and has proven to be a cost-effective fluorescence assay for use as a robust preliminary PARP-1 screen.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».