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Enregistrement W4399894626 · doi:10.1101/2024.06.18.599388

Human research islet cell culture outcomes at the Alberta Diabetes Institute IsletCore

2024· preprint· en· W4399894626 sur OpenAlexaffabout
James Lyon, Alice L. J. Carr, Nancy P Smith, Braulio A. Marfil‐Garza, Aliya F Spigelman, Austin Bautista, Doug O’Gorman, Tatsuya Kin, A. M. James Shapiro, Peter Senior, Patrick E. MacDonald

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIsletDiabetes mellitusMedicineInternal medicineEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Human islets from deceased organ donors have made important contributions to our understanding of pancreatic endocrine function and continue to be an important resource for research studies aimed at understanding, treating, and preventing diabetes. Understanding the impacts of isolation and culture upon the yield of human islets for research is important for planning research studies and islet distribution to distant laboratories. Here we examine islet isolation and cell culture outcomes at the Alberta Diabetes Institute (ADI) IsletCore (n=197). Research-focused isolations typically have a lower yield of islet equivalents (IEQ), with a median of 252,876 IEQ, but a higher purity (median 85%) than clinically-focused isolations before culture. The median recovery of IEQs after culture was 75%, suggesting some loss. This was associated with a shift towards smaller islet particles, indicating possible islet fragmentation, and occurred within 24 hours with no further loss after longer periods of culture (up to 136 hours). No overall change in stimulation index as a measure of islet function was seen with culture time. These findings were replicated in a representative cohort of clinical islet preparations from the Clinical Islet Transplant Program at the University of Alberta. Thus, loss of islets occurs within 24 hours of isolation and there is no further impact of extended culture prior to islet distribution for research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,088
Score d'incertitude au seuil0,175

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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