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Enregistrement W4399929047 · doi:10.1101/2024.06.18.599474

A potent agonist-based PROTAC targeting Pregnane X Receptor that delays colon cancer relapse

2024· preprint· en· W4399929047 sur OpenAlexaff
Lucile Bansard, Guillaume Laconde, V. Delfosse, Tiphaine Huet, Margaux Ayeul, Émilie Rigal, Quentin Donati, Sabine Gerbal‐Chaloin, Martine Daujat‐Chavanieu, Baptiste Legrand, Alain Chavanieu, Anthony R. Martin, Julie Pannequin, William Bourguet, Muriel Amblard, Jean‐Marc Pascussi

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensCanadian Nautical Research Society
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAgonistColorectal cancerPregnaneMedicineReceptorCancerPregnane X receptorOncologyPharmacologyInternal medicineEndocrinologyChemistryNuclear receptorStereochemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Tumor recurrence is often attributed to drug-tolerant cancer stem cells. We previously demonstrated that down regulation of the Pregnane X Receptor (PXR, NR1I2) decreases chemoresistance of cancer stem cells and prevents colorectal cancer recurrence in xenograft mouse models. These is a lack of PXR antagonists that are appropriate for clinical use. In this study, we report the design and synthesis of a novel PXR agonist-based PROTAC (JMV7048) that induces polyubiquitination and degradation of human PXR protein in an E3 CRBN ubiquitin ligase- and the 26S proteasome-dependent manner. This molecule specifically degrades PXR in colon carcinoma, hepatoma, and pancreatic cancer cell lines, but not in primary cultures of human hepatocytes. Crucially, JMV7048 decreased PXR protein expression in colon cancer stem cells and sensitized them to chemotherapy significantly delaying cancer relapse in vivo. PROTACs targeting PXR protein could thus become novel therapeutic agents to enhance cancer cell sensitivity to chemotherapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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