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Enregistrement W4399972410 · doi:10.1128/msphere.00203-24

Metatranscriptomic analysis of common mosquito vector species in the Canadian Prairies

2024· article· en· W4399972410 sur OpenAlex
Cole Baril, Bryan J. Cassone

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevuemSphere · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect symbiosis and bacterial influences
Établissements canadiensBrandon University
Organismes subventionnairesPublic Health AgencyPublic Health Agency of Canada
Mots-clésVector (molecular biology)GeographyZoologyBiologyEcologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The microbiome plays vital roles in the life history of mosquitoes, including their development, immunity, longevity, and vector competence. Recent advances in sequencing technologies have allowed for detailed exploration into the diverse microorganisms harbored by these medically important insects. Although these meta-studies have cataloged the microbiomes of mosquitoes in several continents, much of the information currently available for North America is limited to the state of California. In this study, we collected >35,000 mosquitoes throughout Manitoba, Canada, over a 3-year period and then harnessed RNA sequencing and targeted reverse transcriptase-PCR to characterize the microbiomes of the eight most pervasive and important vector and pest species. The consensus microbiome of each species was overwhelmingly composed of viruses but also included fungi, bacteria, protozoa, and parasitic invertebrates. The microbial assemblages were heterogeneous between species, even within the same genus. We detected notable pathogens, including the causal agents of Cache Valley Fever, avian malaria, and canine heartworm. The remaining microbiome consisted largely of putatively insect-specific viruses that are not well characterized, including 17 newly discovered viruses from 10 different families. Future research should focus on evaluating the potential application of these viruses in biocontrol, as biomarkers, and/or in disrupting mosquito vectorial capacity. Interestingly, we also detected viruses that naturally infect honeybees and thrips, which were presumably acquired indirectly through nectar foraging behaviors. Overall, we provide the first comprehensive catalog of the microorganisms harbored by the most common and important mosquito vectors and pests in the Canadian Prairies. IMPORTANCE: Mosquitoes are the most dangerous animals on the planet, responsible for over 800,000 deaths per year globally. This is because they carry and transmit a plethora of human disease-causing microorganisms, such as West Nile virus and the malaria parasite. Recent innovations in nucleic acid sequencing technologies have enabled researchers unparalleled opportunities to characterize the suite of microorganisms harbored by different mosquito species, including the causal agents of disease. In our study, we carried out 3 years of intensive mosquito surveillance in Canada. We collected and characterized the microorganisms harbored by >35,000 mosquitoes, including the identification of the agents of Cache Valley fever, avian malaria, and canine heartworm. We also detected insect-specific viruses and discovered 17 new viruses that have never been reported. This study, which is the first of its kind in Canada and one of only a handful globally, will greatly aid in future infectious disease research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,744
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle