Focus on proteolysis
Notice bibliographique
Résumé
Proteolysis is an essential cellular function mediating the processing and turnover of proteins to remove damaged or inactive proteins, alter protein function (binding or enzymatic activities), and ensure appropriate protein stoichiometries in the cell.The post-translational control of protein stability is also a central feature of cellular signaling in eukaryotes, i.e. regulating the turnover of important regulatory proteins, and is crucial for almost all aspects of plant biology, including vegetative growth, development, reproduction, and stress responses.Proteolysis plays a central role in hormone signaling pathways, plant defense against pests and pathogens, abiotic stress responses, and basic cell functions like the cell cycle, metabolism, organellar biogenesis and maintenance, and senescence.Compared with animals, plant genomes encode a highly expanded number of components related to proteolytic pathways including the ubiquitin-proteasome system, autophagy, programmed cell death, endosomal trafficking, and organelle-associated protein degradation.Recent advances in molecular genetics and cell biology, microscopy and high-resolution imaging, in vivo labeling, proteomics, mass spectrometry, and structural biology have led to new insights and understanding in many areas of plant proteolysis, including autophagy of chloroplasts and other organelles, degradation of membrane proteins, the discovery of plant N-degron pathways, and proteolytic processing involved in plant development and environmental responses (immunity and abiotic stress).Knowledge of plant proteolytic systems is also important for agriculture and plant breeding, given the impact on plant growth and development related to yield, as well as plant resistance to pests and diseases.This focus issue on plant proteolysis includes two letters to the editor, one commentary, nine review articles, and eight original research articles.The two letters address the question of whether the polyubiquitin pathway operates inside intact chloroplasts.The question is posed by van Wijk and Adam (2024), with a Reply from Jarvis et al. (2024).Researchers on both sides of the debate make valid points to be considered.We eagerly await more definitive data to arrive at a complete understanding of protein degradation inside chloroplasts.The commentary by Eckardt et al.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».