Characterizing putative glycosyltransferases within the flagella glycosylation island (FGI) of <i>Aeromonas hydrophila</i> ATCC 7966 <sup>T</sup>
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Motility is an important virulence factor for many pathogenic bacteria, enabling locomotion towards favourable conditions and away from hostile environments. Flagellar-mediated motility is driven by one or more flagellar filaments that extend outside of the cell and rapidly rotate to generate movement. These filaments are assembled through the polymerization of thousands of copies of structural flagellin proteins. It has been shown that flagellin glycosylation is often a prerequisite for proper flagella structure and function. Aeromonas hydrophila ATCC 7966 T , a clinical and environmental pathogen, elaborates a single polar flagellum. The polar flagellin structural proteins FlaA and FlaB are glycosylated with a heterologous collection of complex penta- and hexa-saccharide chains. This study characterized the involvement of four genes with homology to known glycosyltransferases located within the A. hydrophila ATCC 7966 T flagellar glycosylation island (FGI) in the biosynthesis of the complex polysaccharide glycans modifying the polar flagellins. Deletion of genes AHA_4167 , AHA_4169 , AHA_4170 , and AHA_4171 were observed to have truncated glycans with sequentially shorter chain length, and all of these mutant strains had reduced motility compared to wild type bacteria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».