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Enregistrement W4400024420 · doi:10.17615/facv-0d26

Germline variants and breast cancer survival in patients with distant metastases at primary breast cancer diagnosis

2024· article· en· W4400024420 sur OpenAlexfundno aff
Jose E. Castelao, Julia Geisler, R.M. Tamimi, Maria Escala-Garcia, Sara Margolin, Minouk J. Schoemaker, Anna Jakubowska, Anthony J. Swerdlow, Alison M. Dunning, David J. Hunter, Melanie Gündert, Harald Surowy, Jaana M. Hartikainen, Peter Kraft, Niclas Håkansson, Thomas Rüdiger, Q. Wang, M.A. Troester, Diether Lambrechts, M. Daly, William Jacot, Kamila Czene, M.W. Beckmann, Heli Nevanlinna, Heiko Becher, Thilo Dörk, Annelie Augustinsson, Kyriaki Michailidou, Tjoung‐Won Park‐Simon, kConFab AOCS Investigators, Manjeet K. Bolla, Atocha Romero, Arif B. Ekici, Ian Tomlinson, D. Mavroudis, P.D.P. Pharoah, M Schmidt, Celine M. Vachon, Georgia Chenevix‐Trench, F.J. Couch, Joe Dennis, A.F. Olshan, J. Chang-Claude, R. Kaaks, Renske Keeman, Hedy S. Rennert, Sander Canisius, Antoinette Hollestelle, U. Hamann, Vessela N. Kristensen, Robert Winqvist, L. Le Marchand, Christopher J. Scott, Hermann Brenner, Lauren R. Teras, T. Bachelot, Per Hall, A. Wolk, Emilie Thomas, Sabine Behrens, Matthias Ruebner, Jan Lubiński, Linetta B. Koppert, T.A. Muranen, R.K. Schmutzler, K. Punie, Melissa C. Southey, Esther M. John, A. Heather Eliassen, Håkan Olsson, Э. К. Хуснутдинова, J. Beesley, Robert Luben, P. Peterlongo, Reiner Hoppe, Volker Arndt, P. Devilee, Elinor J. Sawyer, Masood Manoochehri, A. Lindblom, José Á. García-Sáenz, Argyrios Ziogas, S.J. Chanock, Paolo Radice, Stig E. Bojesen, Arto Mannermaa, D.F. Easton, H. Anton-Culver, Audrey Jung, Mervi Grip, P.A. Fasching, Federico Canzian, Montserrat García‐Closas, G. Rennert, Christopher A. Haiman, Rebecca Roylance, B.A.M. Heemskerk-Gerritsen, A.V. Patel, Graham G. Giles, Allison W. Kurian, Manuela Gago-Domínguez, Emmanouil Saloustros, John L. Hopper, Marina Bermisheva, Henrik Flyger

Notice bibliographique

RevueUNC Libraries · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteServicio Gallego de SaludInstituto de Salud Carlos IIICancer Council VictoriaOulun YliopistoNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilCenters for Disease Control and PreventionHellenic Health FoundationXunta de GaliciaInstitut Gustave-RoussyNorges ForskningsrådDeutsche KrebshilfeInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleUniversity of CreteVetenskapsrådetStockholms Läns LandstingWorld Cancer Research FundStavros Niarchos FoundationKuopion Yliopistollinen SairaalaKarolinska InstitutetGovernment of CanadaMinisterio de Sanidad, Servicios Sociales e IgualdadNational Institutes of HealthGentofte HospitalDeutsche Gesetzliche UnfallversicherungMutuelle Générale de l'Education NationaleOvarian Cancer Research FundBundesministerium für Bildung und ForschungMinisterio de Economía y CompetitividadCanadian Institutes of Health ResearchCancerfondenNational Institute for Health and Care ResearchEuropean Regional Development FundAcademy of FinlandKing's College LondonRobert Bosch StiftungKWF KankerbestrijdingCancer Research UKFreistaat SachsenAmerican Cancer SocietyKreftforeningenSundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådCentre International de Recherche sur le CancerLigue Contre le CancerDeutsches KrebsforschungszentrumAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroGenome CanadaItä-Suomen YliopistoFondation du cancer du sein du QuébecEuropean CommissionBreast Cancer Research Foundation
Mots-clésBreast cancerOncologyMedicineGermlineInternal medicineCancerBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Breast cancer metastasis accounts for most of the deaths from breast cancer. Identification of germline variants associated with survival in aggressive types of breast cancer may inform understanding of breast cancer progression and assist treatment. In this analysis, we studied the associations between germline variants and breast cancer survival for patients with distant metastases at primary breast cancer diagnosis. We used data from the Breast Cancer Association Consortium (BCAC) including 1062 women of European ancestry with metastatic breast cancer, 606 of whom died of breast cancer. We identified two germline variants on chromosome 1, rs138569520 and rs146023652, significantly associated with breast cancer-specific survival (P = 3.19 × 10−8 and 4.42 × 10−8). In silico analysis suggested a potential regulatory effect of the variants on the nearby target genes SDE2 and H3F3A. However, the variants showed no evidence of association in a smaller replication dataset. The validation dataset was obtained from the SNPs to Risk of Metastasis (StoRM) study and included 293 patients with metastatic primary breast cancer at diagnosis. Ultimately, larger replication studies are needed to confirm the identified associations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,674

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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