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Enregistrement W4400026451 · doi:10.1016/j.ymthe.2024.06.033

An aptamer-mediated base editing platform for simultaneous knockin and multiple gene knockout for allogeneic CAR-T cells generation

2024· article· en· W4400026451 sur OpenAlexaff
Immacolata Porreca, Robert Blassberg, Jennifer Harbottle, Bronwyn Joubert, Olga Mielczarek, Jesse Stombaugh, Kevin Hemphill, Jonathan Sumner, Deividas Pazeraitis, Julia Liz Touza, Margherita Francescatto, Mike Firth, Tommaso Selmi, Juan Carlos Collantes, Žaklina Strezoska, Ben Taylor, Ceri M. Wiggins, Anja van Brabant Smith, John Lambourne

Notice bibliographique

RevueMolecular Therapy · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensTrinity College
Organismes subventionnairesNew Jersey Commission on Cancer ResearchAstraZenecaRutgers, The State University of New JerseyU.S. Department of Defense
Mots-clésCRISPRGenome editingCas9BiologyTranscription activator-like effector nucleaseZinc finger nucleaseComputational biologyGene knockoutNucleasePoint mutationPalindromeGeneGeneticsGuide RNAGene targetingMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gene editing technologies hold promise for enabling the next generation of adoptive cellular therapies. In conventional gene editing platforms that rely on nuclease activity, such as clustered regularly interspaced short palindromic repeats CRISPR-associated protein 9 (CRISPR-Cas9), allow efficient introduction of genetic modifications; however, these modifications occur via the generation of DNA double-strand breaks (DSBs) and can lead to unwanted genomic alterations and genotoxicity. Here, we apply a novel modular RNA aptamer-mediated Pin-point base editing platform to simultaneously introduce multiple gene knockouts and site-specific integration of a transgene in human primary T cells. We demonstrate high editing efficiency and purity at all target sites and significantly reduced frequency of chromosomal translocations compared with the conventional CRISPR-Cas9 system. Site-specific knockin of a chimeric antigen receptor and multiplex gene knockout are achieved within a single intervention and without the requirement for additional sequence-targeting components. The ability to perform complex genome editing efficiently and precisely highlights the potential of the Pin-point platform for application in a range of advanced cell therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,317
Score d'incertitude au seuil0,948

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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