Association of RNA-sequencing signatures with clinical outcomes of pembrolizumab + chemotherapy in patients with metastatic nonsquamous non–small cell lung cancer (NSCLC) enrolled in the phase 2 KEYNOTE-782 trial.
Notice bibliographique
Résumé
8578 Background: KEYNOTE-782 (NCT03664024) was a single-arm phase 2 study designed to assess possible biomarkers of response (objective response rate [ORR]) to first-line pembrolizumab + chemotherapy (pemetrexed + carboplatin or cisplatin) in patients with previously untreated metastatic nonsquamous NSCLC. Herein, we examined relationships between the T-cell–inflamed gene expression profile (TcellinfGEP) and other tumor microenvironment consensus signatures and efficacy of pembrolizumab + chemotherapy in an exploratory analysis of KEYNOTE-782. Methods: All patients were to receive pembrolizumab 200 mg Q3W, pemetrexed 500 mg/m2 Q3W, and 4 Q3W cycles of carboplatin AUC 5 mg/mL/min or cisplatin 75 mg/m2. Using tumor samples, RNA sequencing was used to measure expression of the TcellinfGEP and 10 non-TcellinfGEP signatures (angiogenesis, gMDSC, glycolysis, hypoxia, mMDSC, MYC, proliferation, RAS, stromal/EMT/TGFβ, and WNT). The association between each signature and clinical outcomes was analyzed using logistic regression (ORR) and Cox proportional hazards regression (progression-free survival [PFS] and overall survival [OS]); the prespecified significance level was α = 0.05 for TcellinfGEP (hypothesized positive association) and α = 0.10 for non-TcellinfGEP signatures (hypothesized negative associations). The clinical utility of TcellinfGEP was descriptively assessed using a prespecified cutoff of the first tertile. The clinical database cutoff was November 5, 2021. Results: Of 117 patients enrolled, 69 (59.0%) had evaluable RNA-sequencing data. TcellinfGEP was not associated with ORR ( P = 0.183), PFS ( P = 0.071), or OS ( P = 0.142); the area under the receiver operating characteristic curve for discriminating response was 0.56 (95% CI, 0.42-0.71). None of the 10 non-TcellinfGEP consensus signatures showed a statistically significant association with clinical outcomes after adjusting for TcellinfGEP (multiplicity adjusted P > 0.10). ORR and median PFS were comparable in the TcellinfGEP low and nonlow subgroups; there was a trend towards longer OS in the nonlow subgroup (Table). Conclusions: In this exploratory analysis of patients with metastatic nonsquamous NSCLC, none of the RNA-sequencing signatures evaluated were associated with clinical outcomes of pembrolizumab + chemotherapy. There was little evidence of clinical utility of TcellinfGEP when evaluated as a dichotomous variable. Data support the use of pembrolizumab + chemotherapy as first-line therapy for patients with nonsquamous NSCLC regardless of consensus signature status. Clinical trial information: NCT03664024 . [Table: see text]
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».