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Enregistrement W4400037517 · doi:10.3390/cancers16132348

Deep Learning Algorithms for Bladder Cancer Segmentation on Multi-Parametric MRI

2024· article· en· W4400037517 sur OpenAlexaff
Kazım Gümüş, Julien Nicolas, Dheeraj Reddy Gopireddy, José Dolz, Seyed Behzad Jazayeri, Mark Bandyk

Notice bibliographique

RevueCancers · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBladder and Urothelial Cancer Treatments
Établissements canadiensÉcole de Technologie SupérieureHEC Montréal
Organismes subventionnairesInformatics Institute, University of Florida
Mots-clésSegmentationArtificial intelligenceBladder cancerComputer scienceParametric statisticsDeep learningAlgorithmMedicineCancerInternal medicineMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Bladder cancer (BC) segmentation on MRI images is the first step to determining the presence of muscular invasion. This study aimed to assess the tumor segmentation performance of three deep learning (DL) models on multi-parametric MRI (mp-MRI) images. METHODS: We studied 53 patients with bladder cancer. Bladder tumors were segmented on each slice of T2-weighted (T2WI), diffusion-weighted imaging/apparent diffusion coefficient (DWI/ADC), and T1-weighted contrast-enhanced (T1WI) images acquired at a 3Tesla MRI scanner. We trained Unet, MAnet, and PSPnet using three loss functions: cross-entropy (CE), dice similarity coefficient loss (DSC), and focal loss (FL). We evaluated the model performances using DSC, Hausdorff distance (HD), and expected calibration error (ECE). RESULTS: The MAnet algorithm with the CE+DSC loss function gave the highest DSC values on the ADC, T2WI, and T1WI images. PSPnet with CE+DSC obtained the smallest HDs on the ADC, T2WI, and T1WI images. The segmentation accuracy overall was better on the ADC and T1WI than on the T2WI. The ECEs were the smallest for PSPnet with FL on the ADC images, while they were the smallest for MAnet with CE+DSC on the T2WI and T1WI. CONCLUSIONS: Compared to Unet, MAnet and PSPnet with a hybrid CE+DSC loss function displayed better performances in BC segmentation depending on the choice of the evaluation metric.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,359
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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