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Enregistrement W4400052330 · doi:10.61919/jhrr.v4i2.964

Exploring Genetic Variants in Ellis-Van Creveld Syndrome: Insights from a Consanguineous Family

2024· article· en· W4400052330 sur OpenAlexaff
Maryam Khalid, Abdullah Sajid, Ammar Mehfooz, Usama Khalil Qadri, Shahzeera Begum, Mohsan Aslam, Rehmatullah Zadran, Mehak Khalid, Waseem Ahmed

Notice bibliographique

RevueJournal of Health and Rehabilitation Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneticsGenealogyConsanguinityBiologyHistory

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Ellis-Van Creveld Syndrome (EVC) is a rare genetic disorder characterized by skeletal abnormalities and developmental anomalies, presenting significant challenges in diagnosis and understanding its genetic underpinnings. Objective: This study aimed to comprehensively investigate the clinical and molecular aspects of EVC within a consanguineous family from Pakistan, identifying the genetic variants involved. Methods: A detailed clinical assessment was conducted on all family members, documenting phenotypic features such as polydactyly, syndactyly, dental abnormalities, and short stature. Pedigrees were constructed following established guidelines to depict familial relationships and inheritance patterns. Venous blood samples were collected for genomic DNA extraction using the Phenol-Chloroform Method. Microsatellite marker analysis was performed for linkage mapping, guided by the UCSC Genome Browser and Rutgers Combined Linkage-Physical Map. Mutation screening of the EVC and EVC2 genes was conducted using Sanger sequencing, with primers designed targeting exon-intron boundaries and coding exons. PCR amplification and sequencing were performed according to standard protocols. Data analysis was carried out using SPSS version 25. Results: Clinical assessment revealed classical EVC phenotypes, including bilateral postaxial polydactyly in 80% of affected individuals and dental abnormalities in 70%. Microsatellite marker analysis identified linkage to the EVC/EVC2 locus on chromosome 4p16.2. However, Sanger sequencing of the 21 coding exons of EVC and the 22 exons of EVC2 did not detect any pathogenic mutations. Haplotype analysis confirmed the segregation of specific markers with affected individuals, suggesting the involvement of additional genetic factors. Conclusion: The study's findings challenge the traditional understanding of EVC, highlighting the necessity for advanced genomic techniques such as whole-genome sequencing to fully elucidate its genetic contributors. These insights underscore the heterogeneous nature of EVC and emphasize the importance of comprehensive genetic screening for accurate diagnosis and personalized management of this rare genetic disorder.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,813
Score d'incertitude au seuil0,290

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,366
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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