A Flexible Semi-automated Assay for Assessing Radiation-sensitization and Toxicity in the Mouse Intestine
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND/AIM: The aim of this study was to develop an enhanced intestinal toxicity assay with three outputs assessing proliferation, villi morphology and DNA damage after irradiation. MATERIALS AND METHODS: Whole 5 cm jejunal lengths were collected from mice following total body x-ray irradiation (0-15 Gy) at 0-84 h. Tissues were wrapped into swirls for cryopreservation and immunohistochemically stained for EdU, CD31, and γH2AX. A semi-automated image analysis was developed for the proliferation, villi morphology, and DNA damage models. RESULTS: Proliferation assessed via EdU staining varied with cycles of damage repair, hyperproliferation, and homeostasis after radiation, with the time to onset of each cycle variable based on radiation dose. An analysis model evaluating the amount of proliferation per unit length of jejunum analyzed was developed, with a dose-response curve identified at 48 h post treatment. The villi length model measured the length of intact and healthy CD31-stained capillary beds between the crypts and villi tips at 3.5 days post treatment within a 0-10 Gy dose range. The DNA damage model evaluated the intensity of γH2AX staining within cellular nuclei, with a useful dose-response identified at 1 h post-radiation treatment. CONCLUSION: This assay demonstrates flexibility for assessing radiation-induced damage, with analysis of proliferation, villi length, or direct DNA damage achievable at defined time points and within useful radiation dose curves. The software-assisted image analysis allows for rapid, comprehensive, and objective data generation with an assay turnover time of days instead of weeks on samples that are representative of most of the treated jejunum.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».