Dysanapsis Genetic Risk Predicts Lung Function Across the Lifespan
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Rationale Dysanapsis refers to a mismatch between airway tree caliber and lung size arising early in life. Dysanapsis assessed by computed tomography (CT) is evident by early adulthood and associated with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) risk later in life. Objectives By examining the genetic factors associated with CT-assessed dysanapsis, we aimed to elucidate its molecular underpinnings and physiological significance across the lifespan. Methods We performed a genome-wide association study of CT-assessed dysanapsis in 11,951 adults, including individuals from two population-based and two COPD-enriched studies. We applied colocalization analysis to integrate genome-wide association study and gene expression data from whole blood and lung. Genetic variants associated with dysanapsis were combined into a genetic risk score that was applied to examine association with lung function in children from a population-based birth cohort (n = 1,278) and adults from the UKBiobank (n = 369,157). Measurements and Main Results CT-assessed dysanapsis was associated with genetic variants from 21 independent signals in 19 gene regions, implicating HHIP (hedgehog interacting protein), DSP, and NPNT as potential molecular targets based on colocalization of their expression. A higher dysanapsis genetic risk score was associated with obstructive spirometry among 5-year-old children and among adults in the fifth, sixth, and seventh decades of life. Conclusions CT-assessed dysanapsis is associated with variation in genes previously implicated in lung development, and dysanapsis genetic risk is associated with obstructive lung function from early life through older adulthood. Dysanapsis may represent an endophenotype link between the genetic variations associated with lung function and COPD.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».