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Enregistrement W4400108877 · doi:10.1007/s00216-024-05413-7

Characterization of biotinylated human ACE2 and SARS-CoV-2 Omicron BA.4/5 spike protein reference materials

2024· article· en· W4400108877 sur OpenAlexafffundabout
Bradley B. Stocks, Marie-Pier Thibeault, Denis L’Abbé, Muhammad Umer, Yali Liu, Matthew Stuible, Yves Durocher, Jeremy E. Melanson

Notice bibliographique

RevueAnalytical and Bioanalytical Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesNational Research Council Canada
Mots-clésBiotinylationChemistryChromatographyBradford protein assayMass spectrometryCoronavirus disease 2019 (COVID-19)CoronavirusBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Accurate diagnostic and serology assays are required for the continued management of the COVID-19 pandemic yet spike protein mutations and intellectual property concerns with antigens and antibodies used in various test kits render comparability assessments difficult. As the use of common, well-characterized reagents can help address this lack of standardization, the National Research Council Canada has produced two protein reference materials (RMs) for use in SARS-CoV-2 serology assays: biotinylated human angiotensin-converting enzyme 2 RM, ACE2-1, and SARS-CoV-2 Omicron BA.4/5 spike protein RM, OMIC-1. Reference values were assigned through a combination of amino acid analysis via isotope dilution liquid chromatography tandem mass spectrometry following acid hydrolysis, and ultraviolet–visible (UV–Vis) spectrophotometry at 280 nm. Vial-to-vial homogeneity was established using UV–Vis measurements, and protein oligomeric status, monitored by size exclusion liquid chromatography (LC-SEC), was used to evaluate transportation, storage, and freeze–thaw stabilities. The molar protein concentration in ACE2-1 was 25.3 ± 1.7 µmol L −1 ( k = 2, 95% CI) and consisted almost exclusively (98%) of monomeric ACE2, while OMIC-1 contained 5.4 ± 0.5 µmol L −1 ( k = 2) spike protein in a mostly (82%) trimeric form. Glycoprotein molar mass determination by LC-SEC with multi-angle light scattering detection facilitated calculation of corresponding mass concentrations. To confirm protein functionality, the binding of OMIC-1 to immobilized ACE2-1 was investigated with surface plasmon resonance and the resulting dissociation constant, K D ~ 4.4 nM, was consistent with literature values. Graphical Abstract

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,768

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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