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Enregistrement W4400112296 · doi:10.1016/j.lungcan.2024.107863

Clinical and pathological predictors of engraftment for patient-derived xenografts in lung adenocarcinoma

2024· article· en· W4400112296 sur OpenAlexaff
Hiroyuki Ogawa, T. Koga, Nhu‐An Pham, Nicholas Bernards, Alexander Gregor, Yuki Sata, Shinsuke Kitazawa, Yoshihisa Hiraishi, Tsukasa Ishiwata, Masato Aragaki, Fumi Yokote, Andrew Effat, Kate Kazlovich, Quan Li, Katrina Hueniken, Ming Li, Yoshimasa Maniwa, Ming‐Sound Tsao, Kazuhiro Yasufuku

Notice bibliographique

RevueLung Cancer · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreToronto General HospitalUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicinePathologicalAdenocarcinomaLungOncologyInternal medicineAdenocarcinoma of the lungPathologyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Patient-derived xenografts (PDXs) are increasingly utilized in preclinical drug efficacy studies due to their ability to retain the molecular, histological, and drug response characteristics of patient tumors. This study aimed to investigate the factors influencing the successful engraftment of PDXs. Lung adenocarcinoma PDXs were established using freshly resected tumor tissues obtained through surgery. Radiological data of pulmonary nodules from this PDX cohort were analyzed, categorizing them into solid tumors and tumors with ground-glass opacity (GGO) based on preoperative CT images. Gene mutation status was obtained from next generation sequencing data and MassARRAY panel. A total of 254 resected primary lung adenocarcinomas were utilized for PDX establishment, with successful initial engraftment in 58 cases (22.8 %); stable engraftment defined as at least three serial passages was observed in 43 cases (16.9 %). The stable engraftment rates of PDXs from solid tumors and tumors with GGO were 22.1 % (42 of 190 cases) and 1.6 % (1 of 64 cases), respectively (P < 0.001). Adenocarcinomas with advanced stage, poor differentiation, solid histologic subtype, and KRAS or TP53 gene mutations were associated with stable PDX engraftment. Avoiding tumors with GGO features could enhance the cost-effectiveness of establishing PDX models from early-stage resected lung adenocarcinomas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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