A new Antarctic species of <i>Orchomenella</i> G.O. Sars, 1890 (Amphipoda: Lysianassoidea: Tryphosidae): is phase-contrast micro-tomography a mature technique for digital holotypes?
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The purpose of this paper is to describe a new species of Antarctic amphipod of the genus Orchomenella Sars, 1890, Orchomenella rinamontiae sp. nov., and to investigate whether high-resolution images of the surface anatomy obtained ‘in situ’ with synchrotron radiation X-ray phase-contrast micro-tomography (SR-PhC micro-CT) can replace classical approaches to describe a new species. The phylogenetic analyses based on the gene COI support the morphologically based taxonomic assignment. The SR-PhC micro-CT was useful for viewing the three-dimensional reconstructions, with the great advantages that the specimen could be rotated around all axes and that it was possible digitally to remove sections of the image that might have obscured areas of the amphipod on which we were focusing. However, it is not yet a completely reliable technique to describe a new species fully. Classical descriptions using light microscopy and scanning electron microscopy are still necessary. Nevertheless, SR-PhC micro-CT is a promising technique that has the potential to revolutionize the way we study biological samples, accelerating the study of biodiversity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».