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Enregistrement W4400190355 · doi:10.1021/acs.jmedchem.4c00761

Discovery of a Highly Potent and Selective HDAC8 Degrader: Advancing the Functional Understanding and Therapeutic Potential of HDAC8

2024· article· en· W4400190355 sur OpenAlexaff
Yufeng Xiao, Nikee Awasthee, Yi Liu, Chengcheng Meng, Michael Y. He, Seth Hale, Rashmi Karki, Zongtao Lin, Megan Mosterio, Benjamin A. García, Robert Kridel, Daiqing Liao, Guangrong Zheng

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHistone Deacetylase Inhibitors Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeWashington University School of Medicine in St. LouisFlorida Department of HealthNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésHDAC8ChemistryHDAC3AcetylationHistone deacetylaseBiochemistryHistoneGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HDAC8 plays crucial roles in biological processes, from gene regulation to cell motility, making it a highly desirable target for therapeutic intervention. HDAC8 also has deacetylase-independent activity which cannot be blocked by a conventional inhibitor. In this study, we report the discovery of YX862, a highly potent and selective hydrazide-based HDAC8-proteolysis targeting chimera (PROTAC) degrader. The selectivity is achieved through rational design of the warhead to spare HDAC3 activity from the previous HDAC3/8 dual degrader YX968. We demonstrate that the degradation of HDAC8 by YX862 increases acetylation levels of its nonhistone substrates such as SMC3 without significantly triggering histone PTM, supporting HDAC8's major role in nonhistone PTM regulation. YX862 exhibits promising on-target antiproliferative activity against DLBCL cells with higher potency than the HDAC8 selective inhibitor PCI-34051. As a selective HDAC8 degrader that avoids pan-HDAC inhibition, YX862 represents a valuable tool for exploring the biological and therapeutic potential of HDAC8.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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